RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	AMN	Q9BXJ7	453 aa		28.9	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	GJD2	Q9UKL4	321 aa		28.9	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		28.9	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	ADCY3	O60266	1144 aa		28.89	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	PGK2	P07205	417 aa		28.89	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		28.89	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	NSMF	Q6X4W1	530 aa		28.89	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	TNS4	Q8IZW8	715 aa		28.89	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	APBA2	Q99767	749 aa		28.89	■■■□□ 2.22
GPS1-223	ENST00000584229	ABCB11	O95342	1321 aa		28.89	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		28.89	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		28.88	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	KIF2C	Q99661	725 aa		28.88	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		28.88	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	LCT	P09848	1927 aa		28.88	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	NID2	Q14112	1375 aa		28.88	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	ELN	P15502	786 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	SMARCA1	P28370	1054 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	PPP2R5B	Q15173	497 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	RABEP1	Q15276	862 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	MTMR8	Q96EF0	704 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		28.86	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	NFIB	O00712	420 aa		28.86	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	EVC	P57679	992 aa		28.86	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	IRF5	Q13568	498 aa		28.86	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		28.86	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		28.86	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		28.86	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	MCM3AP	O60318	1980 aa		28.85	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	CPLX1	O14810	134 aa		28.85	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	GRK4	P32298	578 aa		28.85	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	TRAF1	Q13077	416 aa		28.85	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		28.85	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	PFAS	O15067	1338 aa		28.85	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	USP6NL	Q92738	828 aa		28.84	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	COBL	O75128	1261 aa		28.83	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	PPFIA3	O75145	1194 aa		28.83	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	CCL14	Q16627	93 aa		28.83	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		28.83	■■■□□ 2.21
GPS1-223	ENST00000584229	POTEB2	H3BUK9	544 aa		28.82	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	ST18	O60284	1047 aa		28.82	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	CALML3	P27482	149 aa		28.82	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		28.82	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		28.82	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		28.82	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	TRIB2	Q92519	343 aa		28.82	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	PHKB	Q93100	1093 aa		28.82	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	28.81	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		28.81	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		28.81	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	LARGE1	O95461	756 aa		28.8	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	HMGCR	P04035	888 aa		28.8	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	SCRN1	Q12765	414 aa		28.8	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		28.8	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		28.8	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		28.8	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	PFKFB2	O60825	505 aa		28.79	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	CFB	P00751	764 aa		28.79	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	UBXN2A	P68543	259 aa		28.79	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	FUT2	Q10981	343 aa		28.79	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	ME3	Q16798	604 aa		28.79	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	28.79	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	NECAB1	Q8N987	351 aa		28.79	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	MAML3	Q96JK9	1138 aa		28.79	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		28.79	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	INHA	P05111	366 aa		28.78	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	HOXC6	P09630	235 aa		28.78	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	CNTN2	Q02246	1040 aa		28.78	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		28.78	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		28.78	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		28.78	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	IFNAR1	P17181	557 aa		28.77	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		28.77	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	ABHD8	Q96I13	439 aa		28.77	■■■□□ 2.2
GPS1-223	ENST00000584229	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		28.76	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	CDKL5	O76039	1030 aa		28.76	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	NAPA	P54920	295 aa		28.76	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	TRIM32	Q13049	653 aa		28.76	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		28.76	■■■□□ 2.19

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms