RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567594.1

SSSCA1-AS1-201, Transcript of SSSCA1 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

BASIC

Gene SSSCA1-AS1, Length 614 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 RNF146Q9NTX7 359 aa27.11■■□□□ 1.93
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 PEX10O60683 326 aa27.1■■□□□ 1.93
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 FCER1AP12319 257 aa27.1■■□□□ 1.93
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 SCG2P13521 617 aa27.1■■□□□ 1.93
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 SLC4A3P48751 1232 aa27.1■■□□□ 1.93
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 GPR142Q7Z601 462 aa27.1■■□□□ 1.93
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 HSCBQ8IWL3 235 aa27.1■■□□□ 1.93
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 PHKBQ93100 1093 aa27.1■■□□□ 1.93
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 EFCC1Q9HA90 598 aa27.1■■□□□ 1.93
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 RIPK3Q9Y572 518 aa27.1■■□□□ 1.93
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 SLC15A5A6NIM6 579 aa27.09■■□□□ 1.93
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 PRMT2P55345 433 aa27.09■■□□□ 1.93
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 USH1GQ495M9 461 aa27.09■■□□□ 1.93
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 WDR78Q5VTH9 848 aa27.09■■□□□ 1.93
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 PPP1R18Q6NYC8 613 aa27.09■■□□□ 1.93
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CCDC83Q8IWF9 413 aa27.09■■□□□ 1.93
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 PIBF1Q8WXW3 757 aa27.09■■□□□ 1.93
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 PTPREP23469 700 aa27.08■■□□□ 1.93
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 KCTD2Q14681 263 aa27.08■■□□□ 1.93
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 SOCS4Q8WXH5 440 aa27.08■■□□□ 1.93
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 GLT8D2Q9H1C3 349 aa27.08■■□□□ 1.93
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 SH3GLB2Q9NR46 395 aa27.08■■□□□ 1.93
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 PFASO15067 1338 aa27.08■■□□□ 1.93
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CEP350Q5VT06 3117 aa27.07■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CTDNEP1O95476 244 aa27.07■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa27.07■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CD99L2Q8TCZ2 262 aa27.07■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 TRIM47Q96LD4 638 aa27.07■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 MMP19Q99542 508 aa27.07■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 BARHL2Q9NY43 387 aa27.07■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 SLC5A4Q9NY91 659 aa27.07■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 KIF3AQ9Y496 699 aa27.07■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 XBP1P17861 261 aa27.06■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 LBX1P52954 281 aa27.06■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 PKN1Q16512 942 aa27.06■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ANKRD35Q8N283 1001 aa27.06■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 NUDT12Q9BQG2 462 aa27.06■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 HOMER2Q9NSB8 354 aa27.06■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa27.05■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 PTPDC1A2A3K4 754 aa27.05■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ST3GAL1Q11201 340 aa27.05■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CUL4AQ13619 759 aa27.05■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 GRB14Q14449 540 aa27.05■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CCDC148Q8NFR7 591 aa27.05■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa27.05■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CLEC4DQ8WXI8 215 aa27.05■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 DDX11Q96FC9 970 aa27.05■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 PRDM10Q9NQV6 1147 aa27.05■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 WWC2Q6AWC2 1192 aa27.04■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 NAPAP54920 295 aa27.03■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 GHRHRQ02643 423 aa27.03■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 MUM1L1Q5H9M0 696 aa27.03■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 MORN1Q5T089 497 aa27.03■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa27.03■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 MYH6P13533 1939 aa27.02■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ESYT2A0FGR8 921 aa27.02■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 STXBP3O00186 592 aa27.02■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CTGFP29279 349 aa27.02■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 BECN1Q14457 450 aa27.02■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 RNF207Q6ZRF8 634 aa27.02■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 PSTPIP2Q9H939 334 aa27.02■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 SRRDQ9UH36 339 aa27.02■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 GJD2Q9UKL4 321 aa27.02■■□□□ 1.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 NFIBO00712 420 aa27.01■■□□□ 1.91
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ADORA2AP29274 412 aa27.01■■□□□ 1.91
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 GNA11P29992 359 aa27.01■■□□□ 1.91
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 RGS2P41220 211 aa27.01■■□□□ 1.91
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 MAP2K5Q13163 448 aa27.01■■□□□ 1.91
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 GALNT17Q6IS24 598 aa27.01■■□□□ 1.91
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 NSMFQ6X4W1 530 aa27.01■■□□□ 1.91
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 DPP9Q86TI2 863 aa27.01■■□□□ 1.91
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 FAM184AQ8NB25 1140 aa27.01■■□□□ 1.91
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP27.01■■□□□ 1.91
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CUL5Q93034 780 aa27.01■■□□□ 1.91
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CYP39A1Q9NYL5 469 aa27.01■■□□□ 1.91
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 PIK3CDO00329 1044 aa27■■□□□ 1.91
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 HOXC6P09630 235 aa27■■□□□ 1.91
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 POLR2MP0CAP2 368 aa27■■□□□ 1.91
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 IRF5Q13568 498 aa27■■□□□ 1.91
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 MCTP2Q6DN12 878 aa27■■□□□ 1.91
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 BICD2Q8TD16 824 aa27■■□□□ 1.91
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 USP6NLQ92738 828 aa27■■□□□ 1.91
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 C6orf50Q9HD87 102 aa27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.1 ms