RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566882.5

CCNDBP1-210, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-210ENST00000566882 PSMD14O00487 310 aa11.48□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 NEMFO60524 1076 aa11.48□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR52Z1P0C646 297 aa11.48□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 SMARCA1P28370 1054 aa11.48□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 TNNI2P48788 182 aa11.48□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 ADCY7P51828 1080 aa11.48□□□□□ -0.57
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CCNDBP1-210ENST00000566882 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa11.48□□□□□ -0.57
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CCNDBP1-210ENST00000566882 USP17L13C9JLJ4 530 aa11.48□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 USP17L11C9JVI0 530 aa11.48□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 USP17L18D6R9N7 530 aa11.48□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 USP17L22D6RA61 530 aa11.48□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 USP17L17D6RBQ6 530 aa11.48□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 USP17L19D6RCP7 530 aa11.48□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 USP17L20D6RJB6 530 aa11.48□□□□□ -0.57
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CCNDBP1-210ENST00000566882 USP17L24Q0WX57 530 aa11.48□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 USP17L6PQ6QN14 398 aa11.48□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPICE1Q8N0Z3 855 aa11.48□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 EEF2KMTQ96G04 330 aa11.48□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 PRIMPOLQ96LW4 560 aa11.48□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 NUDT12Q9BQG2 462 aa11.48□□□□□ -0.57
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CCNDBP1-210ENST00000566882 A0A1W2PRG0 241 aa11.47□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRIM49BA6NDI0 452 aa11.47□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 GH2P01242 217 aa11.47□□□□□ -0.57
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CCNDBP1-210ENST00000566882 TATDN1Q6P1N9 297 aa11.47□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 HPS3Q969F9 1004 aa11.47□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 MYH7BA7E2Y1 1941 aa11.47□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 POTEMA6NI47 508 aa11.47□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 TNNT1P13805 278 aa11.47□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP11.47□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 PRCPP42785 496 aa11.47□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 PMS1P54277 932 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 ADKP55263 362 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 QRICH1Q2TAL8 776 aa11.47□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa11.47□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 CABP7Q86V35 215 aa11.47□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 TTLL6Q8N841 843 aa11.47□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 CSRNP1Q96S65 589 aa11.47□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 MRIQ9BWK5 157 aa11.47□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 MYO3BQ8WXR4 1341 aa11.47□□□□□ -0.57
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CCNDBP1-210ENST00000566882 ECE1P42892 770 aa11.46□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC1A4P43007 532 aa11.46□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 GSDMDP57764 484 aa11.46□□□□□ -0.57
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CCNDBP1-210ENST00000566882 ICA1Q05084 483 aa11.46□□□□□ -0.57
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPATA1Q5VX52 437 aa11.46□□□□□ -0.57
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CCNDBP1-210ENST00000566882 KLRC3Q07444 240 aa11.46□□□□□ -0.58
CCNDBP1-210ENST00000566882 ABCB5Q2M3G0 1257 aa11.46□□□□□ -0.58
CCNDBP1-210ENST00000566882 KMT5BQ4FZB7 885 aa11.46□□□□□ -0.58
CCNDBP1-210ENST00000566882 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.58
CCNDBP1-210ENST00000566882 LARGE2Q8N3Y3 721 aa11.46□□□□□ -0.58
CCNDBP1-210ENST00000566882 CCDC17Q96LX7 622 aa11.46□□□□□ -0.58
CCNDBP1-210ENST00000566882 MTMR9Q96QG7 549 aa11.46□□□□□ -0.58
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRIM34Q9BYJ4 488 aa11.46□□□□□ -0.58
CCNDBP1-210ENST00000566882 DACH1Q9UI36 760 aa11.46□□□□□ -0.58
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CCNDBP1-210ENST00000566882 ZBTB7AO95365 584 aa11.45□□□□□ -0.58
CCNDBP1-210ENST00000566882 TXLNAP40222 546 aa11.45□□□□□ -0.58
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CCNDBP1-210ENST00000566882 NR1I3Q14994 352 aa11.45□□□□□ -0.58
CCNDBP1-210ENST00000566882 CDKAL1Q5VV42 579 aa11.45□□□□□ -0.58
CCNDBP1-210ENST00000566882 CEP135Q66GS9 1140 aa11.45□□□□□ -0.58
CCNDBP1-210ENST00000566882 MTMR8Q96EF0 704 aa11.45□□□□□ -0.58
CCNDBP1-210ENST00000566882 CCSER1Q9C0I3 900 aa11.45□□□□□ -0.58
CCNDBP1-210ENST00000566882 KANSL2Q9H9L4 492 aa11.45□□□□□ -0.58
CCNDBP1-210ENST00000566882 RIC8AQ9NPQ8 531 aa11.45□□□□□ -0.58
CCNDBP1-210ENST00000566882 CBFA2T2O43439 604 aa11.45□□□□□ -0.58
CCNDBP1-210ENST00000566882 NDUFB10O96000 172 aa11.45□□□□□ -0.58
CCNDBP1-210ENST00000566882 PRPHP41219 470 aa11.45□□□□□ -0.58
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CCNDBP1-210ENST00000566882 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
CCNDBP1-210ENST00000566882 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
CCNDBP1-210ENST00000566882 USH1GQ495M9 461 aa11.45□□□□□ -0.58
CCNDBP1-210ENST00000566882 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
CCNDBP1-210ENST00000566882 KCNK18Q7Z418 384 aa11.45□□□□□ -0.58
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM139Q8IV31 216 aa11.45□□□□□ -0.58
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CCNDBP1-210ENST00000566882 PSTPIP2Q9H939 334 aa11.45□□□□□ -0.58
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