RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565243.2

RNPS1-213, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 2

Gene RNPS1, Length 3,337 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-213	ENST00000565243	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RNPS1-213	ENST00000565243	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RNPS1-213	ENST00000565243	DRC1	Q96MC2	740 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RNPS1-213	ENST00000565243	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RNPS1-213	ENST00000565243	RMND1	Q9NWS8	449 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RNPS1-213	ENST00000565243	EXOC5	O00471	708 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RNPS1-213	ENST00000565243	MOCS3	O95396	460 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RNPS1-213	ENST00000565243	INF2	Q27J81	1249 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RNPS1-213	ENST00000565243	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RNPS1-213	ENST00000565243	IQCA1	Q86XH1	822 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RNPS1-213	ENST00000565243	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RNPS1-213	ENST00000565243	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RNPS1-213	ENST00000565243	EVA1C	P58658	441 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RNPS1-213	ENST00000565243	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RNPS1-213	ENST00000565243	ARL8A	Q96BM9	186 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RNPS1-213	ENST00000565243	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RNPS1-213	ENST00000565243	CPVL	Q9H3G5	476 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RNPS1-213	ENST00000565243	SNX12	Q9UMY4	172 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RNPS1-213	ENST00000565243	SBF2	Q86WG5	1849 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RNPS1-213	ENST00000565243	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		13.46	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	TUBB	P07437	444 aa		13.46	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	IRAK1	P51617	712 aa		13.46	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	SH3GL2	Q99962	352 aa		13.46	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		13.46	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	EFCC1	Q9HA90	598 aa		13.46	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	ORC4	O43929	436 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	CALM1	P0DP23	149 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	CALM2	P0DP24	149 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	CALM3	P0DP25	149 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	PLCG1	P19174	1290 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	DNM2	P50570	870 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	VAV2	P52735	878 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	ATP2B2	Q01814	1243 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	JADE2	Q9NQC1	790 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	ERCC3	P19447	782 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	MECOM	Q03112	1051 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	SH2D4A	Q9H788	454 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	JAG2	Q9Y219	1238 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	KRT86	O43790	486 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	CCT5	P48643	541 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	ZBED6	P86452	979 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	ANO9	A1A5B4	782 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	PRDX5	P30044	214 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	TXNRD1	Q16881	649 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	CAGE1	Q8TC20	777 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	P2RX5	Q93086	422 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	TRIM9	Q9C026	710 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	CP	P00450	1065 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	USP17L8	P0C7I0	530 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	KRT83	P78385	493 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	TMC4	Q7Z404	712 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	MS4A14	Q96JA4	679 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	13.43	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	ITPK1	Q13572	414 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	SMIM5	Q71RC9	77 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	MTMR8	Q96EF0	704 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	STXBP3	O00186	592 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	PSMA7	O14818	248 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	FAM153B	P0C7A2	387 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNPS1-213	ENST00000565243	CCNE1	P24864	410 aa		13.42	□□□□□ -0.26

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