RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563951.1

CCDC33-211, Transcript of coiled-coil domain containing 33, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC33, Length 308 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33-211ENST00000563951 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CCDC33-211ENST00000563951 KCTD2Q14681 263 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC33-211ENST00000563951 WTAPQ15007 396 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC33-211ENST00000563951 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CCDC33-211ENST00000563951 ASPRV1Q53RT3 343 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC33-211ENST00000563951 DPP9Q86TI2 863 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC33-211ENST00000563951 ADGRF4Q8IZF3 695 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC33-211ENST00000563951 FAM133AQ8N9E0 248 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC33-211ENST00000563951 MTMR8Q96EF0 704 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC33-211ENST00000563951 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CCDC33-211ENST00000563951 TMEM106CQ9BVX2 250 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC33-211ENST00000563951 ACAD9Q9H845 621 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC33-211ENST00000563951 JMJD4Q9H9V9 463 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC33-211ENST00000563951 CCPG1Q9ULG6 757 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC33-211ENST00000563951 STK24Q9Y6E0 443 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC33-211ENST00000563951 RPTORQ8N122 1335 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC33-211ENST00000563951 CEP290O15078 2479 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC33-211ENST00000563951 SOWAHBA6NEL2 793 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 CPA1P15085 419 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 RXRAP19793 462 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 MCM5P33992 734 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 CNTN2Q02246 1040 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 QRICH1Q2TAL8 776 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 TKFCQ3LXA3 575 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 LHX8Q68G74 356 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 SLC30A10Q6XR72 485 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF654Q8IZM8 581 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 TRERF1Q96PN7 1200 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 NEK1Q96PY6 1258 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 MTA3Q9BTC8 594 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 KATNBL1Q9H079 304 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 ALPK3Q96L96 1907 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 KLRF2D3W0D1 207 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 OPLAHO14841 1288 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 DDAH1O94760 285 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 PLEKHA8P1O95397 391 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 SGPL1O95470 568 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 RNF20Q5VTR2 975 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 MFSD14CQ5VZR4 134 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 SGMS1Q86VZ5 419 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 TMEM87BQ96K49 555 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 TINF2Q9BSI4 451 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 USP26Q9BXU7 913 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 RIOX1Q9H6W3 641 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 CYP39A1Q9NYL5 469 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 FBXO40Q9UH90 709 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 OGDHLQ9ULD0 1010 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 BRPF3Q9ULD4 1205 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 MYH6P13533 1939 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 ERICH2A1L162 156 aa9.94□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 ADCY6O43306 1168 aa9.94□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 REC8O95072 547 aa9.94□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 LIFRP42702 1097 aa9.94□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 SART3Q15020 963 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 USH1GQ495M9 461 aa9.94□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 HOMEZQ8IX15 550 aa9.94□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 ANKRD35Q8N283 1001 aa9.94□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 NUP133Q8WUM0 1156 aa9.94□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 TBC1D5Q92609 795 aa9.94□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 COL20A1Q9P218 1284 aa9.94□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 PFASO15067 1338 aa9.93□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa9.93□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 POTEB2H3BUK9 544 aa9.93□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 KRT32Q14532 448 aa9.93□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 ANO1Q5XXA6 986 aa9.93□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 APOA5Q6Q788 366 aa9.93□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 NSMFQ6X4W1 530 aa9.93□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 ARMCX2Q7L311 632 aa9.93□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 CATIPQ7Z7H3 387 aa9.93□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 MICU3Q86XE3 530 aa9.93□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa9.93□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 DDX11Q96FC9 970 aa9.93□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 PIGSQ96S52 555 aa9.93□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 VAT1LQ9HCJ6 419 aa9.93□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 DNAH12Q6ZR08 3092 aa9.93□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 NID2Q14112 1375 aa9.92□□□□□ -0.82
CCDC33-211ENST00000563951 ABCB11O95342 1321 aa9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms