RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 TMCC3Q9ULS5 477 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 COL15A1P39059 1388 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 BACH1O14867 736 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 CELF2O95319 508 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 KRT75O95678 551 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 USP17L8P0C7I0 530 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 ME1P48163 572 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 DAB2P98082 770 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 FKBP15Q5T1M5 1219 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
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PTPRB-210ENST00000551525 VPS33BQ9H267 617 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 THEGQ9P2T0 379 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 RASSF10A6NK89 507 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 ENO4A6NNW6 628 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 NDUFAB1O14561 156 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 URI1O94763 535 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 ADCY5O95622 1261 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 PPP1R2P41236 205 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 PRELPP51888 382 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC26Q8TAB7 109 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 TEKT4Q8WW24 435 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 APPBP2Q92624 585 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 CRAMP1Q96RY5 1269 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 CCSER2Q9H7U1 834 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 ADGRB2O60241 1585 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 CROCC2H7BZ55 1655 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 NRXN1Q9ULB1 1477 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 PRC1O43663 620 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 FKTNO75072 461 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 ANXA1P04083 346 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 UBA7P41226 1012 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 PLCB4Q15147 1175 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 DPP9Q86TI2 863 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 MIEF2Q96C03 454 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM47Q96LD4 638 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 SPAG5Q96R06 1193 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 ZBED2Q9BTP6 218 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 GINM1Q9NU53 330 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 MED14O60244 1454 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 CPDO75976 1380 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 ECEL1O95672 775 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM27P14373 513 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 NAT1P18440 290 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 RPS6KA3P51812 740 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 C6orf163Q5TEZ5 329 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
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PTPRB-210ENST00000551525 SPATA5Q8NB90 893 aa6.93□□□□□ -1.3
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PTPRB-210ENST00000551525 RSPH1Q8WYR4 309 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 VAT1LQ9HCJ6 419 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 RAB23Q9ULC3 237 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 EXOC7Q9UPT5 735 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 PNPLA6Q8IY17 1366 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 SYCE3A1L190 88 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 SLC1A4P43007 532 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 SLC8A3P57103 927 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 GSDMDP57764 484 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 CDHR1Q96JP9 859 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 NOL3O60936 208 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 KRT13P13646 458 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 RHBDL3P58872 404 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 SP8Q8IXZ3 490 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 MRGBPQ9NV56 204 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 FAN1Q9Y2M0 1017 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 USP16Q9Y5T5 823 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 KAT6BQ8WYB5 2073 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 EVI5O60447 810 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 MGEA5O60502 916 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 CNGA1P29973 690 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 MFSD14CQ5VZR4 134 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 HAUS3Q68CZ6 603 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 PHC3Q8NDX5 983 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 PIGBQ92521 554 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 OPTNQ96CV9 577 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 NDEL1Q9GZM8 345 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 MIS12Q9H081 205 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
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