RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 TNFRSF25Q93038 417 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 CCDC102AQ96A19 550 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 ZMYND12Q9H0C1 365 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 SH3GLB2Q9NR46 395 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 RBPJLQ9UBG7 517 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 CCPG1Q9ULG6 757 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 KIF3AQ9Y496 699 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 ESYT2A0FGR8 921 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 SMCO2A6NFE2 343 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 H3BQV1 296 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 NFIBO00712 420 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 ZBED4O75132 1171 aa9.37□□□□□ -0.91
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CS-216ENST00000549221 NLRP5P59047 1200 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 UBE2SQ16763 222 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 Q3C1V9 767 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 IFNL1Q8IU54 200 aa9.37□□□□□ -0.91
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CS-216ENST00000549221 PAGR1Q9BTK6 254 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 HOMER2Q9NSB8 354 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 TMEM260Q9NX78 707 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 HOXC10Q9NYD6 342 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa9.37□□□□□ -0.91
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CS-216ENST00000549221 hCG_1984214I3L0E3 225 aa9.36□□□□□ -0.91
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CS-216ENST00000549221 ATP2A1O14983 1001 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 ALAS1P13196 640 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 KRT2P35908 639 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 TM4SF4P48230 202 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 VEGFBP49765 207 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 ADCY7P51828 1080 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 NUCB2P80303 420 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP9.36□□□□□ -0.91
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CS-216ENST00000549221 PLS1Q14651 629 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 MCTP1Q6DN14 999 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 PPP1R18Q6NYC8 613 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 USP17L6PQ6QN14 398 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 BLIDQ8IZY5 108 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 DAGLBQ8NCG7 672 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 CCDC148Q8NFR7 591 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 PGBD1Q96JS3 809 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
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CS-216ENST00000549221 RIC8AQ9NPQ8 531 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 RNF146Q9NTX7 359 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 PNMA3Q9UL41 463 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 PCDHA6Q9UN73 950 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 PCDHA4Q9UN74 947 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 ABCB11O95342 1321 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 FOXN1O15353 648 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 EDIL3O43854 480 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 FDX1P10109 184 aa9.35□□□□□ -0.91
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CS-216ENST00000549221 STAT3P40763 770 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 CLK2P49760 499 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 OAZ1P54368 228 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 NOGQ13253 232 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 SLC30A10Q6XR72 485 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 RIOX2Q8IUF8 465 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 MB21D1Q8N884 522 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 RGS22Q8NE09 1264 aa9.35□□□□□ -0.91
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CS-216ENST00000549221 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
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CS-216ENST00000549221 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
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CS-216ENST00000549221 SPATC1LQ9H0A9 340 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 PORCNQ9H237 461 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 PSTPIP2Q9H939 334 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 PRDM10Q9NQV6 1147 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 COL20A1Q9P218 1284 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
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CS-216ENST00000549221 BCRP11274 1271 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 CALML3P27482 149 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 HSD17B4P51659 736 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 ERVK-9P63128 1117 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 ERVK-24P63145 666 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 GHRHRQ02643 423 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 SREBF2Q12772 1141 aa9.34□□□□□ -0.91
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CS-216ENST00000549221 NBR1Q14596 966 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
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