RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 CHMP4CQ96CF2 233 aa23.26■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF213O14771 459 aa23.25■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 CSF2RAP15509 400 aa23.25■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 Q6ZUG5 572 aa23.25■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC28A3Q9HAS3 691 aa23.25■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 XIRP2A4UGR9 3374 aa23.25■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 CHD7Q9P2D1 2997 aa23.24■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 A0A1W2PRG0 241 aa23.24■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 SHMT1P34896 483 aa23.24■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 PKP1Q13835 747 aa23.24■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 SEPT2Q15019 361 aa23.24■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC83Q8IWF9 413 aa23.24■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa23.24■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 EPHX3Q9H6B9 360 aa23.24■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 REV3LO60673 3130 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC25A27O95847 323 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 ACRP10323 421 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 CYP7A1P22680 504 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 TFF2Q03403 129 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 ST3GAL1Q11201 340 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 KLHDC9Q8NEP7 349 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 ELP1O95163 1332 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 GBF1Q92538 1859 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 CDK7P50613 346 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 EVCP57679 992 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 KCNA10Q16322 511 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM31Q5JXX7 168 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 NCOA7Q8NI08 942 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 HERVK_113Q902F9 699 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 MMP19Q99542 508 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 MBD4O95243 580 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF792Q3KQV3 632 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 ATG4CQ96DT6 458 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 TCEANC2Q96MN5 208 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 GLT1D1Q96MS3 346 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 CNPY2Q9Y2B0 182 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDSP2-204ENST00000548823 FLOT1O75955 427 aa23.2■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 PGK2P07205 417 aa23.2■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 PLCD1P51178 756 aa23.2■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 KCNQ1P51787 676 aa23.2■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 IFNL3Q8IZI9 196 aa23.2■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 MIGA1Q8NAN2 632 aa23.2■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 GTF3C6Q969F1 213 aa23.2■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 PIEZO1Q92508 2521 aa23.19■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 TRAK2O60296 914 aa23.19■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 PFKFB2O60825 505 aa23.19■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 GJB2P29033 226 aa23.19■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 MCM5P33992 734 aa23.19■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 KCTD2Q14681 263 aa23.19■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa23.19■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 NACAP1Q9BZK3 213 aa23.19■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 IL23AQ9NPF7 189 aa23.19■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 GSG1L2A8MUP6 293 aa23.18■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 PDCP20941 246 aa23.18■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM132BQ14DG7 1078 aa23.18■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 MICALL1Q8N3F8 863 aa23.18■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 BRF1Q92994 677 aa23.18■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa23.18■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 ARMT1Q9H993 441 aa23.18■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM184BQ9ULE4 1060 aa23.18■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 STX6O43752 255 aa23.17■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 FGBP02675 491 aa23.17■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 APPP05067 770 aa23.17■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 SYT1P21579 422 aa23.17■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 CST5P28325 142 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 FGD1P98174 961 aa23.17■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 GABPAQ06546 454 aa23.17■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 TRDNQ13061 729 aa23.17■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 GSE1Q14687 1217 aa23.17■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 PARP14Q460N5 1801 aa23.17■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 NECAB1Q8N987 351 aa23.17■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 NAPBQ9H115 298 aa23.17■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa23.16■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 ARVCFO00192 962 aa23.16■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 TLR3O15455 904 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 GPR37L1O60883 481 aa23.16■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 HAND2P61296 217 aa23.16■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 GIMAP6Q6P9H5 292 aa23.16■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 RIOX2Q8IUF8 465 aa23.16■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 LCORLQ8N3X6 602 aa23.16■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
CTDSP2-204ENST00000548823 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms