RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547323.1

GPN3-205, Transcript of GPN-loop GTPase 3, humanhuman

TSL 3

Gene GPN3, Length 541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3-205ENST00000547323 COPB2P35606 906 aa24.15■■□□□ 1.46
GPN3-205ENST00000547323 FLT3LGP49771 235 aa24.15■■□□□ 1.46
GPN3-205ENST00000547323 TKFCQ3LXA3 575 aa24.15■■□□□ 1.46
GPN3-205ENST00000547323 USP6NLQ92738 828 aa24.15■■□□□ 1.46
GPN3-205ENST00000547323 MMP19Q99542 508 aa24.15■■□□□ 1.46
GPN3-205ENST00000547323 AMNQ9BXJ7 453 aa24.15■■□□□ 1.46
GPN3-205ENST00000547323 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa24.15■■□□□ 1.46
GPN3-205ENST00000547323 NFIBO00712 420 aa24.14■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 STRNO43815 780 aa24.14■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 FCER1AP12319 257 aa24.14■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 HOXD10P28358 340 aa24.14■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 GRB14Q14449 540 aa24.14■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 ACAD9Q9H845 621 aa24.14■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa24.14■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 ST18O60284 1047 aa24.13■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 COBLO75128 1261 aa24.13■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 PGK2P07205 417 aa24.13■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 IFNAR1P17181 557 aa24.13■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 CYP2B6P20813 491 aa24.13■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 ADORA2AP29274 412 aa24.13■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 ST3GAL1Q11201 340 aa24.13■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 TBC1D5Q92609 795 aa24.13■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 NUDT12Q9BQG2 462 aa24.13■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 FBXO40Q9UH90 709 aa24.13■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.13■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 CPLX1O14810 134 aa24.12■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 MAP2K5Q13163 448 aa24.12■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 KCTD2Q14681 263 aa24.12■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 GTF3C6Q969F1 213 aa24.12■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 SLC26A6Q9BXS9 759 aa24.12■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 PNMA2Q9UL42 364 aa24.12■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa24.12■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 ABCB11O95342 1321 aa24.11■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 OPLAHO14841 1288 aa24.11■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 CTDNEP1O95476 244 aa24.11■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 NSMFQ6X4W1 530 aa24.11■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP24.11■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 ABRAQ8N0Z2 381 aa24.11■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 ANKRD35Q8N283 1001 aa24.11■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP24.11■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 PKN1Q16512 942 aa24.1■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 DPP9Q86TI2 863 aa24.1■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 NPLOC4Q8TAT6 608 aa24.1■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 SOCS4Q8WXH5 440 aa24.1■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 DDX11Q96FC9 970 aa24.1■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa24.1■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 ZNF236Q9UL36 1845 aa24.1■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 CCL14Q16627 93 aa24.09■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 WWC2Q6AWC2 1192 aa24.09■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa24.09■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 RAET1EQ8TD07 263 aa24.09■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 LCTP09848 1927 aa24.08■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa24.08■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 ELNP15502 786 aa24.08■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 RGS2P41220 211 aa24.08■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 PRMT2P55345 433 aa24.08■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 CNTN2Q02246 1040 aa24.08■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 CCDC83Q8IWF9 413 aa24.08■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 CYP39A1Q9NYL5 469 aa24.08■■□□□ 1.45
GPN3-205ENST00000547323 PTPDC1A2A3K4 754 aa24.07■■□□□ 1.44
GPN3-205ENST00000547323 ADCY3O60266 1144 aa24.07■■□□□ 1.44
GPN3-205ENST00000547323 HOXC6P09630 235 aa24.07■■□□□ 1.44
GPN3-205ENST00000547323 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
GPN3-205ENST00000547323 IRF5Q13568 498 aa24.07■■□□□ 1.44
GPN3-205ENST00000547323 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
GPN3-205ENST00000547323 ZNF792Q3KQV3 632 aa24.07■■□□□ 1.44
GPN3-205ENST00000547323 TYW1BQ6NUM6 668 aa24.07■■□□□ 1.44
GPN3-205ENST00000547323 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
GPN3-205ENST00000547323 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
GPN3-205ENST00000547323 SLC30A10Q6XR72 485 aa24.07■■□□□ 1.44
GPN3-205ENST00000547323 IL27Q8NEV9 243 aa24.07■■□□□ 1.44
GPN3-205ENST00000547323 MCOLN1Q9GZU1 580 aa24.07■■□□□ 1.44
GPN3-205ENST00000547323 FLRT1Q9NZU1 646 aa24.07■■□□□ 1.44
GPN3-205ENST00000547323 SCG2P13521 617 aa24.06■■□□□ 1.44
GPN3-205ENST00000547323 CALML3P27482 149 aa24.06■■□□□ 1.44
GPN3-205ENST00000547323 RPS6P62753 249 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
GPN3-205ENST00000547323 TRAF1Q13077 416 aa24.06■■□□□ 1.44
GPN3-205ENST00000547323 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
GPN3-205ENST00000547323 RNF207Q6ZRF8 634 aa24.06■■□□□ 1.44
GPN3-205ENST00000547323 TMX3Q96JJ7 454 aa24.06■■□□□ 1.44
GPN3-205ENST00000547323 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
GPN3-205ENST00000547323 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
GPN3-205ENST00000547323 SOWAHBA6NEL2 793 aa24.05■■□□□ 1.44
GPN3-205ENST00000547323 POTEB2H3BUK9 544 aa24.05■■□□□ 1.44
GPN3-205ENST00000547323 STXBP3O00186 592 aa24.05■■□□□ 1.44
GPN3-205ENST00000547323 JAK2O60674 1132 aa24.05■■□□□ 1.44
GPN3-205ENST00000547323 CFBP00751 764 aa24.05■■□□□ 1.44
GPN3-205ENST00000547323 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
GPN3-205ENST00000547323 TRIM22Q8IYM9 498 aa24.05■■□□□ 1.44
GPN3-205ENST00000547323 FAM133AQ8N9E0 248 aa24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms