RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539784.1

TSPAN9-IT1-201, TSPAN9 intronic transcript 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene TSPAN9-IT1, Length 562 nt, Biotype sense intronic.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 KAT14Q9H8E8 782 aa14.96□□□□□ -0.01
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 ASTN1O14525 1302 aa14.95□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 PTPDC1A2A3K4 754 aa14.95□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 NFIBO00712 420 aa14.95□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 ACLYP53396 1101 aa14.95□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 TLE2Q04725 743 aa14.95□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 CCDC178Q5BJE1 867 aa14.95□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa14.95□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 DGKHQ86XP1 1220 aa14.95□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 VTI1AQ96AJ9 217 aa14.95□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 UBA5Q9GZZ9 404 aa14.95□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 SPC25Q9HBM1 224 aa14.95□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 STARD7Q9NQZ5 370 aa14.95□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 PDLIM7Q9NR12 457 aa14.95□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 ZSWIM5Q9P217 1185 aa14.95□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 TNKSO95271 1327 aa14.94□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 SNHG28P0DPA3 235 aa14.94□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 CHMLP26374 656 aa14.94□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 TNFAIP2Q03169 654 aa14.94□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 USH1GQ495M9 461 aa14.94□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 KLHDC9Q8NEP7 349 aa14.94□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 NUP133Q8WUM0 1156 aa14.94□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 RUFY2Q8WXA3 655 aa14.94□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 UBAC1Q9BSL1 405 aa14.94□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 KRT23Q9C075 422 aa14.94□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 KATNBL1Q9H079 304 aa14.94□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 CNNM2Q9H8M5 875 aa14.94□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 RAD50Q92878 1312 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 TRIM43BA6NCK2 446 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 PTGS1P23219 599 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 CALML3P27482 149 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 BEX3Q00994 111 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 GNASQ5JWF2 1037 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 C1orf53Q5VUE5 145 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 SLC30A10Q6XR72 485 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 BADQ92934 168 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 PDGFCQ9NRA1 345 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 DNAH12Q6ZR08 3092 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 LRRC37A2A6NM11 1700 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 LTBP2Q14767 1821 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 MOXD2PA6NHM9 499 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 ASGR1P07306 291 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 CLTBP09497 229 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 CST5P28325 142 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 GJA9P57773 515 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 PTH1RQ03431 593 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 RNF207Q6ZRF8 634 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 TLK2Q86UE8 772 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 CLEC4DQ8WXI8 215 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 GLT1D1Q96MS3 346 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 LCTP09848 1927 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 SMPD1P17405 629 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 NT5C2P49902 561 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 TRDNQ13061 729 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 LRIT3Q3SXY7 679 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 ASPRV1Q53RT3 343 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 CYB5R4Q7L1T6 521 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 ANKS1AQ92625 1134 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 AP5M1Q9H0R1 490 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 VAT1LQ9HCJ6 419 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 TMEM39AQ9NV64 488 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 WDR19Q8NEZ3 1342 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 DCDC2CA8MYV0 355 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 RAG1P15918 1043 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 ITGB8P26012 769 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 TMEM63BQ5T3F8 832 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 TAPT1Q6NXT6 567 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 Q7L0L9 218 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 ADGRF4Q8IZF3 695 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 VTA1Q9NP79 307 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 PNMA2Q9UL42 364 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 CTAGE5O15320 804 aa14.89□□□□□ -0.03
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 SGSM2O43147 1006 aa14.89□□□□□ -0.03
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 CYP21A2P08686 494 aa14.89□□□□□ -0.03
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 RPS6P62753 249 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 PDE4DQ08499 809 aa14.89□□□□□ -0.03
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 FAAP100Q0VG06 881 aa14.89□□□□□ -0.03
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 SHHQ15465 462 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms