RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526055.5

TSPAN4-216, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-216ENST00000526055 SOWAHBA6NEL2 793 aa21.54■■□□□ 1.04
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TSPAN4-216ENST00000526055 STAG2Q8N3U4 1231 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN4-216ENST00000526055 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
TSPAN4-216ENST00000526055 TMEM87BQ96K49 555 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN4-216ENST00000526055 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-216ENST00000526055 A0A1W2PQY0 241 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-216ENST00000526055 CALML3P27482 149 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-216ENST00000526055 ACLYP53396 1101 aa21.46■■□□□ 1.03
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