RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521962.1

HACE1-211, Transcript of HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 4

Gene HACE1, Length 561 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1-211ENST00000521962 FGD4Q96M96 766 aa19.22■□□□□ 0.67
HACE1-211ENST00000521962 TRERF1Q96PN7 1200 aa19.22■□□□□ 0.67
HACE1-211ENST00000521962 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
HACE1-211ENST00000521962 RIOX1Q9H6W3 641 aa19.22■□□□□ 0.67
HACE1-211ENST00000521962 ACAD9Q9H845 621 aa19.22■□□□□ 0.67
HACE1-211ENST00000521962 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
HACE1-211ENST00000521962 FBXO40Q9UH90 709 aa19.22■□□□□ 0.67
HACE1-211ENST00000521962 SLC12A7Q9Y666 1083 aa19.22■□□□□ 0.67
HACE1-211ENST00000521962 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
HACE1-211ENST00000521962 NFIBO00712 420 aa19.21■□□□□ 0.67
HACE1-211ENST00000521962 PSMA5P28066 241 aa19.21■□□□□ 0.67
HACE1-211ENST00000521962 ZNF792Q3KQV3 632 aa19.21■□□□□ 0.67
HACE1-211ENST00000521962 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa19.21■□□□□ 0.67
HACE1-211ENST00000521962 FBXL16Q8N461 479 aa19.21■□□□□ 0.67
HACE1-211ENST00000521962 CLEC4DQ8WXI8 215 aa19.21■□□□□ 0.67
HACE1-211ENST00000521962 TM6SF1Q9BZW5 370 aa19.21■□□□□ 0.67
HACE1-211ENST00000521962 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa19.2■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 RUFY3Q7L099 469 aa19.2■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 DPP9Q86TI2 863 aa19.2■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 BRF1Q92994 677 aa19.2■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 MAML3Q96JK9 1138 aa19.2■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 RNF208Q9H0X6 261 aa19.2■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 UNC93B1Q9H1C4 597 aa19.2■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 VAT1LQ9HCJ6 419 aa19.2■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 SMCHD1A6NHR9 2005 aa19.2■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 ASTN1O14525 1302 aa19.2■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 LCTP09848 1927 aa19.19■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 KIF5BP33176 963 aa19.19■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 ANAPC15P60006 121 aa19.19■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 APOBRQ0VD83 1088 aa19.19■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 USH1GQ495M9 461 aa19.19■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 OLFML2BQ68BL8 750 aa19.19■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 TMTC3Q6ZXV5 915 aa19.19■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 DPF3Q92784 378 aa19.19■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 PIGSQ96S52 555 aa19.19■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 HTATIP2Q9BUP3 242 aa19.19■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 SPZ1Q9BXG8 430 aa19.19■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 ALPK3Q96L96 1907 aa19.19■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 NID2Q14112 1375 aa19.19■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 ZBTB5O15062 677 aa19.18■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 CALM1P0DP23 149 aa19.18■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 CALM2P0DP24 149 aa19.18■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 CALM3P0DP25 149 aa19.18■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 CYP2C19P33261 490 aa19.18■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 UBXN2AP68543 259 aa19.18■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 CNTN2Q02246 1040 aa19.18■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 HOMER1Q86YM7 354 aa19.18■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 ANKRD35Q8N283 1001 aa19.18■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 FAM133AQ8N9E0 248 aa19.18■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 FANCBQ8NB91 859 aa19.18■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 CYP39A1Q9NYL5 469 aa19.18■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 UNC80Q8N2C7 3258 aa19.17■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 GOLGA8BA8MQT2 603 aa19.17■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 OPLAHO14841 1288 aa19.17■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 ZBTB43O43298 467 aa19.17■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 RCAN1P53805 252 aa19.17■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 FUT2Q10981 343 aa19.17■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 SLC30A10Q6XR72 485 aa19.17■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 FBXO11Q86XK2 927 aa19.17■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 TRPV1Q8NER1 839 aa19.17■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 DDX11Q96FC9 970 aa19.17■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa19.17■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa19.17■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 DNAH12Q6ZR08 3092 aa19.17■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 GOLGA8AA7E2F4 631 aa19.16■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 CYBAP13498 195 aa19.16■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 CDC27P30260 824 aa19.16■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 EVCP57679 992 aa19.16■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 FGD1P98174 961 aa19.16■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 NSMFQ6X4W1 530 aa19.16■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 SLC5A4Q9NY91 659 aa19.16■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 PNMA2Q9UL42 364 aa19.16■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 PFASO15067 1338 aa19.16■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 ABCB11O95342 1321 aa19.16■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa19.16■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 LRRC37A2A6NM11 1700 aa19.15■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 SOWAHBA6NEL2 793 aa19.15■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 SGPL1O95470 568 aa19.15■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 SMARCA1P28370 1054 aa19.15■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 RTN1Q16799 776 aa19.15■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 PIBF1Q8WXW3 757 aa19.15■□□□□ 0.66
HACE1-211ENST00000521962 LZTS2Q9BRK4 669 aa19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms