RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517979.1

CCDC25-202, Transcript of coiled-coil domain containing 25, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCDC25, Length 877 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC25-202ENST00000517979 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
CCDC25-202ENST00000517979 CNNM2Q9H8M5 875 aa16.1■□□□□ 0.17
CCDC25-202ENST00000517979 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CCDC25-202ENST00000517979 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CCDC25-202ENST00000517979 POTEB2H3BUK9 544 aa16.09■□□□□ 0.17
CCDC25-202ENST00000517979 ICAM1P05362 532 aa16.09■□□□□ 0.17
CCDC25-202ENST00000517979 AKR1A1P14550 325 aa16.09■□□□□ 0.17
CCDC25-202ENST00000517979 ZNF543Q08ER8 600 aa16.09■□□□□ 0.17
CCDC25-202ENST00000517979 LRRC26Q2I0M4 334 aa16.09■□□□□ 0.17
CCDC25-202ENST00000517979 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa16.09■□□□□ 0.17
CCDC25-202ENST00000517979 BTNL9Q6UXG8 535 aa16.09■□□□□ 0.17
CCDC25-202ENST00000517979 DGKHQ86XP1 1220 aa16.09■□□□□ 0.17
CCDC25-202ENST00000517979 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CCDC25-202ENST00000517979 MFRPQ9BY79 579 aa16.09■□□□□ 0.17
CCDC25-202ENST00000517979 KAT14Q9H8E8 782 aa16.09■□□□□ 0.17
CCDC25-202ENST00000517979 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CCDC25-202ENST00000517979 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa16.09■□□□□ 0.17
CCDC25-202ENST00000517979 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
CCDC25-202ENST00000517979 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 SYN1P17600 705 aa16.08■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 CNTN2Q02246 1040 aa16.08■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 LRRC41Q15345 812 aa16.08■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 PNMA1Q8ND90 353 aa16.08■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 FGD4Q96M96 766 aa16.08■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 UBAC1Q9BSL1 405 aa16.08■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 TNKSO95271 1327 aa16.08■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 SNHG28P0DPA3 235 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 PTH1RQ03431 593 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 MUM1L1Q5H9M0 696 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 NSMFQ6X4W1 530 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 ARMCX2Q7L311 632 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 ZSWIM5Q9P217 1185 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 FAM184BQ9ULE4 1060 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 SMCHD1A6NHR9 2005 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 MCM3APO60318 1980 aa16.06■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 SGSM2O43147 1006 aa16.06■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 PGK1P00558 417 aa16.06■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 GOLGA8HP0CJ92 632 aa16.06■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 TRDNQ13061 729 aa16.06■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 ACVR2BQ13705 512 aa16.06■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 RNF180Q86T96 592 aa16.06■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa16.06■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 FAM133AQ8N9E0 248 aa16.06■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 CYP39A1Q9NYL5 469 aa16.06■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 ADCYAP1R1P41586 468 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 ANKS1AQ92625 1134 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 FERMT2Q96AC1 680 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 PNMA2Q9UL42 364 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 SOWAHBA6NEL2 793 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 ASB14A6NK59 587 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 CYP21A2P08686 494 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 RTP1P59025 263 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 ASPRV1Q53RT3 343 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 UBA5Q9GZZ9 404 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 PRO3102Q9H379 93 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 CPVLQ9H3G5 476 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 WDR19Q8NEZ3 1342 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 PTPDC1A2A3K4 754 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 NFIBO00712 420 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 CCDC144BQ3MJ40 725 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 CYB5R4Q7L1T6 521 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 PHF24Q9UPV7 400 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 ASTN1O14525 1302 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 ADAMTS4O75173 837 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 USH1GQ495M9 461 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 SKAP1Q86WV1 359 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 GDF15Q99988 308 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 KATNBL1Q9H079 304 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 SPC25Q9HBM1 224 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 PCDH10Q9P2E7 1040 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
CCDC25-202ENST00000517979 ERICH2A1L162 156 aa16.01■□□□□ 0.15
CCDC25-202ENST00000517979 E7EWF7 191 aa16.01■□□□□ 0.15
CCDC25-202ENST00000517979 ADCY6O43306 1168 aa16.01■□□□□ 0.15
CCDC25-202ENST00000517979 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms