RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-223ENST00000515011 SLC1A4P43007 532 aa25.8■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 KLHL10Q6JEL2 608 aa25.8■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.8■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 CABP7Q86V35 215 aa25.8■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 POTEDQ86YR6 584 aa25.8■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 CUL5Q93034 780 aa25.8■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 GMLQ99445 158 aa25.8■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 KCND1Q9NSA2 647 aa25.8■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 SPDYE2BA6NHP3 402 aa25.8■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 SPDYE6P0CI01 402 aa25.8■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa25.8■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa25.8■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 MTMR9Q96QG7 549 aa25.8■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 KBTBD4Q9NVX7 518 aa25.8■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 EDIL3O43854 480 aa25.79■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 LARGE2Q8N3Y3 721 aa25.79■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 IGSF22Q8N9C0 903 aa25.79■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 GDF11O95390 407 aa25.79■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 SEMA3FQ13275 785 aa25.79■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 CDKAL1Q5VV42 579 aa25.79■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 CSRNP1Q96S65 589 aa25.79■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 VPS33BQ9H267 617 aa25.79■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 TMOD2Q9NZR1 351 aa25.79■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 PSMD14O00487 310 aa25.78■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 KCNJ6P48051 423 aa25.78■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 STX17P56962 302 aa25.78■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 KCNB1Q14721 858 aa25.78■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 CALCRLQ16602 461 aa25.78■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 UBE2SQ16763 222 aa25.78■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 QRICH1Q2TAL8 776 aa25.78■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 LRRC15Q8TF66 581 aa25.78■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 GMCL1Q96IK5 515 aa25.78■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 HDAC9Q9UKV0 1011 aa25.78■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 CTNND2Q9UQB3 1225 aa25.78■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 UQCRHLA0A096LP55 91 aa25.77■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 RAD17O75943 681 aa25.77■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 UQCRHP07919 91 aa25.77■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 PLCG1P19174 1290 aa25.77■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 TNNI2P48788 182 aa25.77■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP25.77■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 GLT8D2Q9H1C3 349 aa25.77■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 RWDD2AQ9UIY3 292 aa25.77■■□□□ 1.72
PDE4D-223ENST00000515011 A0A1B0GTH6 734 aa25.76■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 SLC37A4O43826 429 aa25.76■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 NRDCO43847 1150 aa25.76■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 TDP2O95551 362 aa25.76■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 TECP42680 631 aa25.76■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 PPP4R3AQ6IN85 833 aa25.76■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 PSTPIP2Q9H939 334 aa25.76■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 F5H6K3 240 aa25.76■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 RAD21O60216 631 aa25.76■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 JAG1P78504 1218 aa25.76■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 KLRC3Q07444 240 aa25.76■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa25.76■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 GH2P01242 217 aa25.75■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 NR1I3Q14994 352 aa25.75■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 MYRIPQ8NFW9 859 aa25.75■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 PLIN2Q99541 437 aa25.75■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 KLRC4O43908 158 aa25.75■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 PAK1Q13153 545 aa25.75■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 DLGAP5Q15398 846 aa25.75■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC112Q8NEF3 446 aa25.75■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 USP27XA6NNY8 438 aa25.74■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 NDUFB10O96000 172 aa25.74■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 TXKP42681 527 aa25.74■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 TMEM266Q2M3C6 531 aa25.74■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 FAM151AQ8WW52 585 aa25.74■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 TCP10L2B9ZVM9 353 aa25.73■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa25.73■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 OGFOD1Q8N543 542 aa25.73■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP25.73■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 GDAQ9Y2T3 454 aa25.73■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 RHOBTB3O94955 611 aa25.73■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 SPDYE2Q495Y8 402 aa25.73■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 KMT5BQ4FZB7 885 aa25.73■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 CTAGE1Q96RT6 745 aa25.73■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa25.73■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 CLRN2A0PK11 232 aa25.72■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 NELFBQ8WX92 580 aa25.72■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 CALML4Q96GE6 196 aa25.72■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 TMX1Q9H3N1 280 aa25.72■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 ZNRF3Q9ULT6 936 aa25.72■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 CNTNAP1P78357 1384 aa25.72■■□□□ 1.71
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