RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CNNM2Q9H8M5 875 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GOLGA8HP0CJ92 632 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ACLYP53396 1101 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KCNA10Q16322 511 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C1orf53Q5VUE5 145 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KLHDC9Q8NEP7 349 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PNMA2Q9UL42 364 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADCY6O43306 1168 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TLE2Q04725 743 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NUP133Q8WUM0 1156 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LRCH3Q96II8 777 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KATNBL1Q9H079 304 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RAD50Q92878 1312 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PTPDC1A2A3K4 754 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MOXD2PA6NHM9 499 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHMLP26374 656 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TNFAIP2Q03169 654 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANKS1AQ92625 1134 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UBAC1Q9BSL1 405 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UBA5Q9GZZ9 404 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 STARD7Q9NQZ5 370 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYADML2A6NDP7 307 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NFIBO00712 420 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TNKSO95271 1327 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GJA9P57773 515 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GNASQ5JWF2 1037 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EEPD1Q7L9B9 569 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 VTI1AQ96AJ9 217 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CPVLQ9H3G5 476 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PDLIM7Q9NR12 457 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ASTN1O14525 1302 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CST5P28325 142 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LRIT3Q3SXY7 679 aa27.3■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa27.3■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GLT1D1Q96MS3 346 aa27.3■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ASGR1P07306 291 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CALML3P27482 149 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRDNQ13061 729 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 USH1GQ495M9 461 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RNF207Q6ZRF8 634 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CLEC4DQ8WXI8 215 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WDR19Q8NEZ3 1342 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRIM43BA6NCK2 446 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CLTBP09497 229 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PTH1RQ03431 593 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ASPRV1Q53RT3 343 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IQSEC1Q6DN90 963 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BADQ92934 168 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AP5M1Q9H0R1 490 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PDGFCQ9NRA1 345 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LCTP09848 1927 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LTBP2Q14767 1821 aa27.27■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC30A10Q6XR72 485 aa27.27■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 VTA1Q9NP79 307 aa27.27■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SZT2Q5T011 3432 aa27.27■■□□□ 1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ELP1O95163 1332 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DCDC2CA8MYV0 355 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BEX3Q00994 111 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TAPT1Q6NXT6 567 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CYB5R4Q7L1T6 521 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TLK2Q86UE8 772 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADGRF4Q8IZF3 695 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MORC4Q8TE76 937 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 VAT1LQ9HCJ6 419 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM39AQ9NV64 488 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CYP21A2P08686 494 aa27.25■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SMPD1P17405 629 aa27.25■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPS6P62753 249 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LRRC37A2A6NM11 1700 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CTAGE5O15320 804 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SGSM2O43147 1006 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RAG1P15918 1043 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
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