RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502974.1

CXCL3-202, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 2

Gene CXCL3, Length 630 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-202ENST00000502974 NFXL1Q6ZNB6 911 aa29.11■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 VAT1LQ9HCJ6 419 aa29.11■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa29.11■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 ALPK3Q96L96 1907 aa29.1■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 HSPA4P34932 840 aa29.1■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 TROAPQ12815 778 aa29.1■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 ANO1Q5XXA6 986 aa29.1■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF654Q8IZM8 581 aa29.1■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 NUP133Q8WUM0 1156 aa29.1■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 PNMA2Q9UL42 364 aa29.1■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 PFASO15067 1338 aa29.1■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 WDR19Q8NEZ3 1342 aa29.1■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 POTEB2H3BUK9 544 aa29.09■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 USH1GQ495M9 461 aa29.09■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 NSMFQ6X4W1 530 aa29.09■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 JMJD4Q9H9V9 463 aa29.09■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 MCM3APO60318 1980 aa29.09■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 CCDC69A6NI79 296 aa29.08■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa29.08■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 TMTC2Q8N394 836 aa29.08■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 ARRDC4Q8NCT1 418 aa29.08■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 MYL10Q9BUA6 226 aa29.08■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 DNM1LO00429 736 aa29.07■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 NFIBO00712 420 aa29.07■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 LIFRP42702 1097 aa29.07■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 CNTN2Q02246 1040 aa29.07■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 QRICH1Q2TAL8 776 aa29.07■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 KCNB2Q92953 911 aa29.07■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 TCEANC2Q96MN5 208 aa29.07■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 CYP39A1Q9NYL5 469 aa29.07■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 SNX14Q9Y5W7 946 aa29.07■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 DDAH1O94760 285 aa29.06■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 RARBP10826 455 aa29.06■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 COL6A1P12109 1028 aa29.06■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 AKR1A1P14550 325 aa29.06■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 FGD4Q96M96 766 aa29.06■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 KBTBD13C9JR72 458 aa29.05■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 FAM133AQ8N9E0 248 aa29.05■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 CLEC4DQ8WXI8 215 aa29.05■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 LCTP09848 1927 aa29.04■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 ARMCX2Q7L311 632 aa29.04■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 FBXO11Q86XK2 927 aa29.04■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 PTPDC1A2A3K4 754 aa29.03■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 C7orf61Q8IZ16 206 aa29.03■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 MAP3K14Q99558 947 aa29.03■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa29.03■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 SLC12A7Q9Y666 1083 aa29.03■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 ABCB11O95342 1321 aa29.02■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 SOWAHBA6NEL2 793 aa29.02■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 CPA1P15085 419 aa29.02■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 KIF5BP33176 963 aa29.02■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 SLC35G1Q2M3R5 365 aa29.02■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 HOMER1Q86YM7 354 aa29.02■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa29.02■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa29.02■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 USP26Q9BXU7 913 aa29.02■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa29.02■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 FAM184BQ9ULE4 1060 aa29.02■■■□□ 2.24
CXCL3-202ENST00000502974 ASB14A6NK59 587 aa29.01■■■□□ 2.23
CXCL3-202ENST00000502974 CALM1P0DP23 149 aa29.01■■■□□ 2.23
CXCL3-202ENST00000502974 CALM2P0DP24 149 aa29.01■■■□□ 2.23
CXCL3-202ENST00000502974 CALM3P0DP25 149 aa29.01■■■□□ 2.23
CXCL3-202ENST00000502974 RXRAP19793 462 aa29.01■■■□□ 2.23
CXCL3-202ENST00000502974 ACVR2BQ13705 512 aa29.01■■■□□ 2.23
CXCL3-202ENST00000502974 SLC30A10Q6XR72 485 aa29.01■■■□□ 2.23
CXCL3-202ENST00000502974 RNF207Q6ZRF8 634 aa29.01■■■□□ 2.23
CXCL3-202ENST00000502974 SGMS1Q86VZ5 419 aa29.01■■■□□ 2.23
CXCL3-202ENST00000502974 MTMR8Q96EF0 704 aa29.01■■■□□ 2.23
CXCL3-202ENST00000502974 RIOX1Q9H6W3 641 aa29.01■■■□□ 2.23
CXCL3-202ENST00000502974 ZBTB5O15062 677 aa29■■■□□ 2.23
CXCL3-202ENST00000502974 CYTH3O43739 400 aa29■■■□□ 2.23
CXCL3-202ENST00000502974 CALML3P27482 149 aa29■■■□□ 2.23
CXCL3-202ENST00000502974 LRRC41Q15345 812 aa29■■■□□ 2.23
CXCL3-202ENST00000502974 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa29■■■□□ 2.23
CXCL3-202ENST00000502974 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
CXCL3-202ENST00000502974 PIGSQ96S52 555 aa29■■■□□ 2.23
CXCL3-202ENST00000502974 AMNQ9BXJ7 453 aa29■■■□□ 2.23
CXCL3-202ENST00000502974 FGD1P98174 961 aa28.99■■■□□ 2.23
CXCL3-202ENST00000502974 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa28.99■■■□□ 2.23
CXCL3-202ENST00000502974 RNF180Q86T96 592 aa28.99■■■□□ 2.23
CXCL3-202ENST00000502974 MICU3Q86XE3 530 aa28.99■■■□□ 2.23
CXCL3-202ENST00000502974 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
CXCL3-202ENST00000502974 ASTN1O14525 1302 aa28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms