RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 USP17L22D6RA61 530 aa6.57□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.57□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 USP17L19D6RCP7 530 aa6.57□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 USP17L20D6RJB6 530 aa6.57□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 IDH1O75874 414 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 MCAMP43121 646 aa6.57□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZAP70P43403 619 aa6.57□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 RAC1P63000 192 aa6.57□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 USP17L24Q0WX57 530 aa6.57□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 KBTBD3Q8NAB2 608 aa6.57□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 WDR66Q8TBY9 1149 aa6.57□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 GPT2Q8TD30 523 aa6.57□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 PNMA5Q96PV4 448 aa6.57□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 COA1Q9GZY4 146 aa6.57□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 VPS33BQ9H267 617 aa6.57□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 RAI14Q9P0K7 980 aa6.57□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 HMG20BQ9P0W2 317 aa6.57□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 POLLQ9UGP5 575 aa6.57□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 SNX14Q9Y5W7 946 aa6.57□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 CACNA1SQ13698 1873 aa6.57□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 IGSF3O75054 1194 aa6.56□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 SASH3O75995 380 aa6.56□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 LDHCP07864 332 aa6.56□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 IGFBP4P22692 258 aa6.56□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 NOS3P29474 1203 aa6.56□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 DGKZQ13574 1117 aa6.56□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa6.56□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa6.56□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 HFE2Q6ZVN8 426 aa6.56□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.56□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.56□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa6.56□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 MEGF10Q96KG7 1140 aa6.56□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa6.56□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 IL25Q9H293 177 aa6.56□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 CD209Q9NNX6 404 aa6.56□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 HELLSQ9NRZ9 838 aa6.56□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 LRFN2Q9ULH4 789 aa6.56□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 C10orf71Q711Q0 1435 aa6.56□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLX4Q8IY92 1834 aa6.55□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 CHD4Q14839 1912 aa6.55□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 OPLAHO14841 1288 aa6.55□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 PPIP5K2O43314 1243 aa6.55□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 MAP3K6O95382 1288 aa6.55□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 LDHBP07195 334 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
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ARHGEF3-215ENST00000498517 KCNA3P22001 575 aa6.55□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 GSTO1P78417 241 aa6.55□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 RASGRF1Q13972 1273 aa6.55□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 HIF1AQ16665 826 aa6.55□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 HS1BP3Q53T59 392 aa6.55□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 TTLL5Q6EMB2 1281 aa6.55□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.55□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 OLFM4Q6UX06 510 aa6.55□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 FBXO11Q86XK2 927 aa6.55□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.55□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.55□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 JDP2Q8WYK2 163 aa6.55□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 TTC14Q96N46 770 aa6.55□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 RBSNQ9H1K0 784 aa6.55□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 EFCC1Q9HA90 598 aa6.55□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM63CQ9P1W3 806 aa6.55□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa6.55□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 MED23Q9ULK4 1368 aa6.55□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 MICAL2O94851 1124 aa6.54□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 APPP05067 770 aa6.54□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 WEE1P30291 646 aa6.54□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 IREB2P48200 963 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 AK2P54819 239 aa6.54□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 LRP8Q14114 963 aa6.54□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 UBE3CQ15386 1083 aa6.54□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 PI16Q6UXB8 463 aa6.54□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa6.54□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 MAGEB6Q8N7X4 407 aa6.54□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM87AQ8NBN3 555 aa6.54□□□□□ -1.36
ARHGEF3-215ENST00000498517 KCNB2Q92953 911 aa6.54□□□□□ -1.36
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