RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493854.5

RABGAP1-212, Transcript of RAB GTPase activating protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGAP1, Length 575 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGAP1-212ENST00000493854 KDRP35968 1356 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 MEIS3P2A8K0S8 358 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 VSTM5A8MXK1 200 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 AGRPO00253 132 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 SDSP20132 328 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 STAT4Q14765 748 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 TJAP1Q5JTD0 557 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 IL31Q6EBC2 164 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 CCDC70Q6NSX1 233 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 CDC6Q99741 560 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 GRIP2Q9C0E4 1043 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 ANO9A1A5B4 782 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 MMP10P09238 476 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 HMOX1P09601 288 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 GPC1P35052 558 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 GRIA4P48058 902 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 NEK3P51956 506 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 Q6ZVU0 165 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 OR13H1Q8NG92 308 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 SLC7A3Q8WY07 619 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 OSMRQ99650 979 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 TMEM39AQ9NV64 488 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 DACH1Q9UI36 760 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 TRHDEQ9UKU6 1024 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 SCN11AQ9UI33 1791 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 GABRDO14764 452 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 SIAH2O43255 324 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 RPS6KA4O75676 772 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 RFC4P35249 363 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 C1QTNF8P60827 252 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 PPP2R3AQ06190 1150 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 TYRO3Q06418 890 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 LRRC14Q15048 493 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 MINDY4Q4G0A6 757 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 ALFQ53S48 1182 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 FAM209AQ5JX71 171 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 SYDE2Q5VT97 1194 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 SCUBE1Q8IWY4 988 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 CPXCR1Q8N123 301 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 STK11IPQ8N1F8 1099 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 ZNF831Q5JPB2 1677 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 TRAV20A0A0B4J274 112 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 RNMTO43148 476 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 FBXO21O94952 628 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 GYS1P13807 737 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 BMP6P22004 513 aa7.35□□□□□ -1.23
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RABGAP1-212ENST00000493854 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 TCIRG1Q13488 830 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 SPRED3Q2MJR0 410 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 ANO1Q5XXA6 986 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 CCDC174Q6PII3 467 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 PODNQ7Z5L7 613 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 CNTD1Q8N815 330 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 ANKRD42Q8N9B4 389 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 TMEM40Q8WWA1 233 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 TRERF1Q96PN7 1200 aa7.35□□□□□ -1.23
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RABGAP1-212ENST00000493854 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 TRIM8Q9BZR9 551 aa7.35□□□□□ -1.23
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RABGAP1-212ENST00000493854 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 ATP10DQ9P241 1426 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 KIF13BQ9NQT8 1826 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 TNKSO95271 1327 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 A0A096LPE4 126 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 A0A1W2PPZ6 126 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 RASSF10A6NK89 507 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 POTEB2H3BUK9 544 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 CASP2P42575 452 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 RPIAP49247 311 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGAP1-212ENST00000493854 FAAP100Q0VG06 881 aa7.34□□□□□ -1.23
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