RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486480.1

PTPRN-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-216ENST00000486480 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 RUFY3Q7L099 469 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 UNC93B1Q9H1C4 597 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 PFASO15067 1338 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 NFIBO00712 420 aa22.24■■□□□ 1.15
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PTPRN-216ENST00000486480 FBXL16Q8N461 479 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 BRF1Q92994 677 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 ZBTB5O15062 677 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 FBXO11Q86XK2 927 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 HOMER1Q86YM7 354 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 FANCBQ8NB91 859 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 PIGSQ96S52 555 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 RNF208Q9H0X6 261 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 ABCB11O95342 1321 aa22.23■■□□□ 1.15
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PTPRN-216ENST00000486480 SMARCA1P28370 1054 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 CYP2C19P33261 490 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 RCAN1P53805 252 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 APOBRQ0VD83 1088 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 NSMFQ6X4W1 530 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 IL17RAQ96F46 866 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 AMNQ9BXJ7 453 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 GOLGA8AA7E2F4 631 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 GOLGA8BA8MQT2 603 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 POTEB2H3BUK9 544 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 RTN1Q16799 776 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.21■■□□□ 1.15
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PTPRN-216ENST00000486480 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 RPTORQ8N122 1335 aa22.21■■□□□ 1.15
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PTPRN-216ENST00000486480 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 NID2Q14112 1375 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 GJB1P08034 283 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.19■■□□□ 1.14
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PTPRN-216ENST00000486480 TINF2Q9BSI4 451 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 CYBAP13498 195 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 TRAF1Q13077 416 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 ASTN1O14525 1302 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 EVCP57679 992 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 TRPV1Q8NER1 839 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 DEFB118Q96PH6 123 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 EN2P19622 333 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 CALML3P27482 149 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 CDC27P30260 824 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 GJA8P48165 433 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 RPS6P62753 249 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 RGS22Q8NE09 1264 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 SHISA4Q96DD7 197 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 MAF1Q9H063 256 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 OPLAHO14841 1288 aa22.15■■□□□ 1.14
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