RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485617.6

UHRF2-212, Transcript of ubiquitin like with PHD and ring finger domains 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UHRF2, Length 3,460 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF2-212ENST00000485617 NFIL3Q16649 462 aa4.54□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 PPP4R3AQ6IN85 833 aa4.54□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 TXNRD3Q86VQ6 643 aa4.54□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 IQCA1Q86XH1 822 aa4.54□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 MIGA1Q8NAN2 632 aa4.54□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 KIAA0895Q8NCT3 520 aa4.54□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 PNMA5Q96PV4 448 aa4.54□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 NUP58Q9BVL2 599 aa4.54□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 TRIM9Q9C026 710 aa4.54□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 TMEM59LQ9UK28 342 aa4.54□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 RCCD1A6NED2 376 aa4.54□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 NMT2O60551 498 aa4.54□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 PRDM1O75626 825 aa4.54□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 SYF2O95926 243 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 USP14P54578 494 aa4.54□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 GRB10Q13322 594 aa4.54□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 GRAPQ13588 217 aa4.54□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 DDB1Q16531 1140 aa4.54□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 LONRF2Q1L5Z9 754 aa4.54□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 HGSNATQ68CP4 663 aa4.54□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 NELFBQ8WX92 580 aa4.54□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 MRIQ9BWK5 157 aa4.54□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 HAUS4Q9H6D7 363 aa4.54□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 PLAGL2Q9UPG8 496 aa4.54□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 USP20Q9Y2K6 914 aa4.54□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 TTC26A0AVF1 554 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 AGPSO00116 658 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 NRDCO43847 1150 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 CYP2D6P10635 497 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 CCNE1P24864 410 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 KIF5BP33176 963 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 DNM2P50570 870 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 RPS8P62241 208 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 SEPT2Q15019 361 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 TCEAL1Q15170 157 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 GRIK5Q16478 980 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 MOXD1Q6UVY6 613 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 STAG2Q8N3U4 1231 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 DNAJC19Q96DA6 116 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 SEMA6BQ9H3T3 888 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 STK17AQ9UEE5 414 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 CTNND2Q9UQB3 1225 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 RLFQ13129 1914 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 PHIPQ8WWQ0 1821 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 CASP1P29466 404 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 PRDX5P30044 214 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 CHMP4BP1P59074 171 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 ZBED6P86452 979 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 PDE4CQ08493 712 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 CAVIN4Q5BKX8 364 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 ISM2Q6H9L7 571 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 CREG2Q8IUH2 290 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 MREGQ8N565 214 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 KCTD17Q8N5Z5 321 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 WDR66Q8TBY9 1149 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 PRDM10Q9NQV6 1147 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 LRP2BPQ9P2M1 347 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 SWAP70Q9UH65 585 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 FBXL5Q9UKA1 691 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 NOL4O94818 638 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 CPP00450 1065 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 PIP4K2BP78356 416 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 SPIRE1Q08AE8 756 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 PSMD2Q13200 908 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 NNTQ13423 1086 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 BMT2Q1RMZ1 405 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 KRT25Q7Z3Z0 450 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 PROM2Q8N271 834 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 SLC35F6Q8N357 371 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 CCDC148Q8NFR7 591 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 OR8K1Q8NGG5 319 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 SEC14L1Q92503 715 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 UBXN4Q92575 508 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 CAVIN3Q969G5 261 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 CHP1Q99653 195 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 TMEM47Q9BQJ4 181 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 SYT11Q9BT88 431 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 EHD4Q9H223 541 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 BRMS1Q9HCU9 246 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 GDAQ9Y2T3 454 aa4.53□□□□□ -1.68
UHRF2-212ENST00000485617 LCTP09848 1927 aa4.52□□□□□ -1.69
UHRF2-212ENST00000485617 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa4.52□□□□□ -1.69
UHRF2-212ENST00000485617 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms