RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479350.1

HIVEP3-204, Transcript of human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3, humanhuman

TSL 5

Gene HIVEP3, Length 940 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3-204ENST00000479350 ABRAQ8N0Z2 381 aa15.52■□□□□ 0.08
HIVEP3-204ENST00000479350 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
HIVEP3-204ENST00000479350 CLEC4DQ8WXI8 215 aa15.52■□□□□ 0.08
HIVEP3-204ENST00000479350 MAML3Q96JK9 1138 aa15.52■□□□□ 0.08
HIVEP3-204ENST00000479350 PDRG1Q9NUG6 133 aa15.52■□□□□ 0.08
HIVEP3-204ENST00000479350 FBXO40Q9UH90 709 aa15.52■□□□□ 0.08
HIVEP3-204ENST00000479350 SMCHD1A6NHR9 2005 aa15.51■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 PTPDC1A2A3K4 754 aa15.51■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 PPFIA3O75145 1194 aa15.51■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 HOXC6P09630 235 aa15.51■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 CALM1P0DP23 149 aa15.51■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 CALM2P0DP24 149 aa15.51■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 CALM3P0DP25 149 aa15.51■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 ZNF792Q3KQV3 632 aa15.51■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 TKFCQ3LXA3 575 aa15.51■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 TMTC3Q6ZXV5 915 aa15.51■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 FBXO11Q86XK2 927 aa15.51■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 FANCBQ8NB91 859 aa15.51■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 FGD4Q96M96 766 aa15.51■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 POTEB2H3BUK9 544 aa15.5■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 ZBTB5O15062 677 aa15.5■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 CALML3P27482 149 aa15.5■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 CDC27P30260 824 aa15.5■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa15.5■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 MTMR8Q96EF0 704 aa15.5■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 TM6SF1Q9BZW5 370 aa15.5■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 RNF208Q9H0X6 261 aa15.5■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 RIOX1Q9H6W3 641 aa15.5■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 CYP39A1Q9NYL5 469 aa15.5■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 ASTN1O14525 1302 aa15.49■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa15.49■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 LCTP09848 1927 aa15.49■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa15.49■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa15.49■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 DTNBO60941 627 aa15.49■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 STK3Q13188 491 aa15.49■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 MFSD14CQ5VZR4 134 aa15.49■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 TRPV1Q8NER1 839 aa15.49■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 TBC1D5Q92609 795 aa15.49■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 MAP3K14Q99558 947 aa15.49■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 SPZ1Q9BXG8 430 aa15.49■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 AMNQ9BXJ7 453 aa15.49■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 SLC5A4Q9NY91 659 aa15.49■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 PFASO15067 1338 aa15.48■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 ABCB11O95342 1321 aa15.48■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 SOWAHBA6NEL2 793 aa15.48■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 EN2P19622 333 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 ANAPC15P60006 121 aa15.48■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 CCT2P78371 535 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa15.48■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 ANO1Q5XXA6 986 aa15.48■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 OLFML2BQ68BL8 750 aa15.48■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 RNF207Q6ZRF8 634 aa15.48■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 DEFB118Q96PH6 123 aa15.48■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 TMEM106CQ9BVX2 250 aa15.48■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 AGXT2Q9BYV1 514 aa15.48■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa15.48■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 MYH6P13533 1939 aa15.47■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa15.47■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 OPLAHO14841 1288 aa15.47■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 CNGA1P29973 690 aa15.47■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 ADD1P35611 737 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 GNAQP50148 359 aa15.47■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 AK2P54819 239 aa15.47■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 RPS6P62753 249 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 FAM133AQ8N9E0 248 aa15.47■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 SHISA4Q96DD7 197 aa15.47■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 LZTS2Q9BRK4 669 aa15.47■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 C22orf23Q9BZE7 217 aa15.47■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 COL20A1Q9P218 1284 aa15.47■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 CENPFP49454 3210 aa15.47■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 LRRC37A2A6NM11 1700 aa15.46■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 IGHA2P01877 340 aa15.46■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 CYBAP13498 195 aa15.46■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 FUT2Q10981 343 aa15.46■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa15.46■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 TINF2Q9BSI4 451 aa15.46■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
HIVEP3-204ENST00000479350 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms