RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479043.1

ANKRD28-210, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-210ENST00000479043 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
ANKRD28-210ENST00000479043 ZNF394Q53GI3 561 aa5.8□□□□□ -1.48
ANKRD28-210ENST00000479043 SPRED1Q7Z699 444 aa5.8□□□□□ -1.48
ANKRD28-210ENST00000479043 USP48Q86UV5 1035 aa5.8□□□□□ -1.48
ANKRD28-210ENST00000479043 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
ANKRD28-210ENST00000479043 KIAA0825Q8IV33 1275 aa5.8□□□□□ -1.48
ANKRD28-210ENST00000479043 PHACTR4Q8IZ21 702 aa5.8□□□□□ -1.48
ANKRD28-210ENST00000479043 CARFQ8N187 725 aa5.8□□□□□ -1.48
ANKRD28-210ENST00000479043 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
ANKRD28-210ENST00000479043 CCDC74BQ96LY2 380 aa5.8□□□□□ -1.48
ANKRD28-210ENST00000479043 GMIPQ9P107 970 aa5.8□□□□□ -1.48
ANKRD28-210ENST00000479043 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
ANKRD28-210ENST00000479043 SYPP08247 313 aa5.79□□□□□ -1.48
ANKRD28-210ENST00000479043 ATF2P15336 505 aa5.79□□□□□ -1.48
ANKRD28-210ENST00000479043 APOBRQ0VD83 1088 aa5.79□□□□□ -1.48
ANKRD28-210ENST00000479043 NR1I3Q14994 352 aa5.79□□□□□ -1.48
ANKRD28-210ENST00000479043 OVOS1Q6IE37 1185 aa5.79□□□□□ -1.48
ANKRD28-210ENST00000479043 NUP43Q8NFH3 380 aa5.79□□□□□ -1.48
ANKRD28-210ENST00000479043 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
ANKRD28-210ENST00000479043 RNF34Q969K3 372 aa5.79□□□□□ -1.48
ANKRD28-210ENST00000479043 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
ANKRD28-210ENST00000479043 SPON2Q9BUD6 331 aa5.79□□□□□ -1.48
ANKRD28-210ENST00000479043 PCED1AQ9H1Q7 454 aa5.79□□□□□ -1.48
ANKRD28-210ENST00000479043 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
ANKRD28-210ENST00000479043 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa5.79□□□□□ -1.48
ANKRD28-210ENST00000479043 FZD7O75084 574 aa5.78□□□□□ -1.48
ANKRD28-210ENST00000479043 PLATP00750 562 aa5.78□□□□□ -1.48
ANKRD28-210ENST00000479043 GBP1P32455 592 aa5.78□□□□□ -1.48
ANKRD28-210ENST00000479043 RACK1P63244 317 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
ANKRD28-210ENST00000479043 CLCQ05315 142 aa5.78□□□□□ -1.48
ANKRD28-210ENST00000479043 SEZ6Q53EL9 994 aa5.78□□□□□ -1.48
ANKRD28-210ENST00000479043 CDCP2Q5VXM1 449 aa5.78□□□□□ -1.48
ANKRD28-210ENST00000479043 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
ANKRD28-210ENST00000479043 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa5.78□□□□□ -1.48
ANKRD28-210ENST00000479043 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 A0A1W2PQY0 241 aa5.77□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 RGS13O14921 159 aa5.77□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 UBOX5O94941 541 aa5.77□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 TMC3Q7Z5M5 1100 aa5.77□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 CNNM2Q9H8M5 875 aa5.77□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 ERVK13-1Q9NX77 482 aa5.77□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 ZNF165P49910 485 aa5.76□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 MLECQ14165 292 aa5.76□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 ARSHQ5FYA8 562 aa5.76□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 NKD1Q969G9 470 aa5.76□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 ATG4CQ96DT6 458 aa5.76□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 KIF2CQ99661 725 aa5.76□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 RNF38Q9H0F5 515 aa5.76□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 IMPACTQ9P2X3 320 aa5.76□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 ZNRF3Q9ULT6 936 aa5.76□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 TNFRSF10CO14798 259 aa5.75□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 TGM1P22735 817 aa5.75□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 CDSNQ15517 529 aa5.75□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 GK5Q6ZS86 529 aa5.75□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 USP51Q70EK9 711 aa5.75□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 NLRC3Q7RTR2 1065 aa5.75□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 CHST13Q8NET6 341 aa5.75□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 ANTXR1Q9H6X2 564 aa5.75□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 WDR26Q9H7D7 661 aa5.75□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa5.75□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa5.75□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 RAG1P15918 1043 aa5.74□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 CCNFP41002 786 aa5.74□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 RNF4P78317 190 aa5.74□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 ZNF654Q8IZM8 581 aa5.74□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 ZNF747Q9BV97 191 aa5.74□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 PRAMEF1O95521 474 aa5.73□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 NME1P15531 152 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 MCM4P33991 863 aa5.73□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 NBPF9Q3BBW0 867 aa5.73□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 PAQR3Q6TCH7 311 aa5.73□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP5.73□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 FAN1Q9Y2M0 1017 aa5.73□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 SRGAP3O43295 1099 aa5.72□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 CYBBP04839 570 aa5.72□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 DBHP09172 617 aa5.72□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 IMPDH2P12268 514 aa5.72□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 MVKQ03426 396 aa5.72□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa5.72□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 NT5DC4Q86YG4 428 aa5.72□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 RASGRP4Q8TDF6 673 aa5.72□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 JMJD8Q96S16 334 aa5.72□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa5.72□□□□□ -1.49
ANKRD28-210ENST00000479043 SIGLEC6O43699 453 aa5.71□□□□□ -1.5
ANKRD28-210ENST00000479043 ACRP10323 421 aa5.71□□□□□ -1.5
ANKRD28-210ENST00000479043 NCAM1P13591 858 aa5.71□□□□□ -1.5
ANKRD28-210ENST00000479043 MC3RP41968 323 aa5.71□□□□□ -1.5
ANKRD28-210ENST00000479043 GJA8P48165 433 aa5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms