RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 ASB14A6NK59 587 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 PSMA5P28066 241 aa22.02■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.02■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 LHX8Q68G74 356 aa22.02■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.02■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 FBXO11Q86XK2 927 aa22.02■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.02■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.02■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 AMNQ9BXJ7 453 aa22.02■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 SENP2Q9HC62 589 aa22.02■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.02■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 ZBTB5O15062 677 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 CNGA1P29973 690 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 RCAN1P53805 252 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 NSMFQ6X4W1 530 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 FBXL16Q8N461 479 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 ADCK5Q3MIX3 580 aa22■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 TRPV1Q8NER1 839 aa22■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 NUP133Q8WUM0 1156 aa22■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 HTATIP2Q9BUP3 242 aa22■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 SPZ1Q9BXG8 430 aa22■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 USP26Q9BXU7 913 aa22■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 CPVLQ9H3G5 476 aa22■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 SNX14Q9Y5W7 946 aa22■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 B4DLN1 442 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 NFIBO00712 420 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 AKR1A1P14550 325 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 RNF207Q6ZRF8 634 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 NECAB2Q7Z6G3 386 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 DNERQ8NFT8 737 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 FGD4Q96M96 766 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa21.98■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 PPP2R5BQ15173 497 aa21.98■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 USH1GQ495M9 461 aa21.98■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 ARMCX2Q7L311 632 aa21.98■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 ARRDC4Q8NCT1 418 aa21.98■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 MORC4Q8TE76 937 aa21.98■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 VAT1LQ9HCJ6 419 aa21.98■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 PTPDC1A2A3K4 754 aa21.97■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 SOWAHBA6NEL2 793 aa21.97■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 CNTN2Q02246 1040 aa21.97■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 GHRHRQ02643 423 aa21.97■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 FAM184BQ9ULE4 1060 aa21.97■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 RARBP10826 455 aa21.96■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 RPS6P62753 249 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 FGD1P98174 961 aa21.96■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 ACVR2BQ13705 512 aa21.96■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa21.96■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 FANCBQ8NB91 859 aa21.96■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 TM6SF1Q9BZW5 370 aa21.96■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 MYH6P13533 1939 aa21.96■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 SMCHD1A6NHR9 2005 aa21.96■■□□□ 1.11
SYF2-203ENST00000474160 DNM1LO00429 736 aa21.95■■□□□ 1.1
SYF2-203ENST00000474160 CYTH3O43739 400 aa21.95■■□□□ 1.1
SYF2-203ENST00000474160 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa21.95■■□□□ 1.1
SYF2-203ENST00000474160 APOA5Q6Q788 366 aa21.95■■□□□ 1.1
SYF2-203ENST00000474160 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SYF2-203ENST00000474160 LRRC2Q9BYS8 371 aa21.95■■□□□ 1.1
SYF2-203ENST00000474160 AGXT2Q9BYV1 514 aa21.95■■□□□ 1.1
SYF2-203ENST00000474160 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa21.95■■□□□ 1.1
SYF2-203ENST00000474160 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa21.95■■□□□ 1.1
SYF2-203ENST00000474160 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SYF2-203ENST00000474160 ZBTB43O43298 467 aa21.94■■□□□ 1.1
SYF2-203ENST00000474160 RPS6KB1P23443 525 aa21.94■■□□□ 1.1
SYF2-203ENST00000474160 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SYF2-203ENST00000474160 ANAPC15P60006 121 aa21.94■■□□□ 1.1
SYF2-203ENST00000474160 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SYF2-203ENST00000474160 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SYF2-203ENST00000474160 PIGSQ96S52 555 aa21.94■■□□□ 1.1
SYF2-203ENST00000474160 MYL10Q9BUA6 226 aa21.94■■□□□ 1.1
SYF2-203ENST00000474160 VTA1Q9NP79 307 aa21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 219.7 ms