RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473252.5

C9orf85-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 85, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf85, Length 678 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85-204ENST00000473252 RGS22Q8NE09 1264 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf85-204ENST00000473252 FGD4Q96M96 766 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf85-204ENST00000473252 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
C9orf85-204ENST00000473252 CYP39A1Q9NYL5 469 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf85-204ENST00000473252 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
C9orf85-204ENST00000473252 KBTBD13C9JR72 458 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf85-204ENST00000473252 CDC45O75419 566 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf85-204ENST00000473252 LCTP09848 1927 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf85-204ENST00000473252 SNAP25P60880 206 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf85-204ENST00000473252 TRAF1Q13077 416 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf85-204ENST00000473252 ACVR2BQ13705 512 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf85-204ENST00000473252 WTAPQ15007 396 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf85-204ENST00000473252 MUM1L1Q5H9M0 696 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf85-204ENST00000473252 ARMCX2Q7L311 632 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf85-204ENST00000473252 RNF180Q86T96 592 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf85-204ENST00000473252 MAP3K14Q99558 947 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf85-204ENST00000473252 ABCB11O95342 1321 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf85-204ENST00000473252 H0YGN5 161 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf85-204ENST00000473252 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
C9orf85-204ENST00000473252 GOLGA8HP0CJ92 632 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf85-204ENST00000473252 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.78□□□□□ -0.04
C9orf85-204ENST00000473252 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf85-204ENST00000473252 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf85-204ENST00000473252 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
C9orf85-204ENST00000473252 ADGRF4Q8IZF3 695 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf85-204ENST00000473252 PIP4P2Q8N4L2 257 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf85-204ENST00000473252 MORC4Q8TE76 937 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf85-204ENST00000473252 TMEM87BQ96K49 555 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf85-204ENST00000473252 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
C9orf85-204ENST00000473252 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
C9orf85-204ENST00000473252 UBA5Q9GZZ9 404 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf85-204ENST00000473252 ANO2Q9NQ90 1003 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf85-204ENST00000473252 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf85-204ENST00000473252 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 SOWAHBA6NEL2 793 aa14.77□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 B4DLN1 442 aa14.77□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 SLC27A2O14975 620 aa14.77□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 MCM5P33992 734 aa14.77□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 CNTN2Q02246 1040 aa14.77□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 LRRC41Q15345 812 aa14.77□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 CREB3L3Q68CJ9 461 aa14.77□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 NSMFQ6X4W1 530 aa14.77□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 RNF207Q6ZRF8 634 aa14.77□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 SAMD3Q8N6K7 520 aa14.77□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 DNERQ8NFT8 737 aa14.77□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa14.77□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 CLEC4DQ8WXI8 215 aa14.77□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 LRRC37A2A6NM11 1700 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 KLRF2D3W0D1 207 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 SMARCA1P28370 1054 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 NKX3-2P78367 333 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 TROAPQ12815 778 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 GRM4Q14833 912 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 TSGA10IPQ3SY00 556 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 TMEM67Q5HYA8 995 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 C1orf53Q5VUE5 145 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 CATIPQ7Z7H3 387 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 MCF2L2Q86YR7 1114 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 MTMR8Q96EF0 704 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 KATNBL1Q9H079 304 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 JMJD4Q9H9V9 463 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 SPC25Q9HBM1 224 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 MAD2L2Q9UI95 211 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 PTPDC1A2A3K4 754 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 MOXD2PA6NHM9 499 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 NFIBO00712 420 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 ADAMTS4O75173 837 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 DDAH1O94760 285 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 CST5P28325 142 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 LIFRP42702 1097 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 ANTXR2P58335 489 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 CCDC144BQ3MJ40 725 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 ANO1Q5XXA6 986 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 IQSEC1Q6DN90 963 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 FBXO11Q86XK2 927 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 AMNQ9BXJ7 453 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 RIOX1Q9H6W3 641 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 VTA1Q9NP79 307 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 PPP4R2Q9NY27 417 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 PHF24Q9UPV7 400 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 Q9Y3F1 56 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 TAF6LQ9Y6J9 622 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 ZBTB5O15062 677 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 GJA9P57773 515 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 RPS6P62753 249 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 KRT32Q14532 448 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf85-204ENST00000473252 SNX17Q15036 470 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms