RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449186.2

RPRD1B-202, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-202ENST00000449186 GNRH1P01148 92 aa12.79□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 FCER1AP12319 257 aa12.79□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 HOXD10P28358 340 aa12.79□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 RBM25P49756 843 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP12.79□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 MTFR1Q15390 333 aa12.79□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 NSMFQ6X4W1 530 aa12.79□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 SLC30A10Q6XR72 485 aa12.79□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa12.79□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 FBXL16Q8N461 479 aa12.79□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 MAP3K14Q99558 947 aa12.79□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa12.79□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 ASTN1O14525 1302 aa12.79□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa12.79□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 ZNF236Q9UL36 1845 aa12.78□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 ZBTB5O15062 677 aa12.78□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 CALM1P0DP23 149 aa12.78□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 CALM2P0DP24 149 aa12.78□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 CALM3P0DP25 149 aa12.78□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 FDX1P10109 184 aa12.78□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 GRK4P32298 578 aa12.78□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 KIF5BP33176 963 aa12.78□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 CYP2C19P33261 490 aa12.78□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 RGS2P41220 211 aa12.78□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 EVCP57679 992 aa12.78□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 KCTD2Q14681 263 aa12.78□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 ARHGEF6Q15052 776 aa12.78□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 ZNF792Q3KQV3 632 aa12.78□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa12.78□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 DPP9Q86TI2 863 aa12.78□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 FBXO11Q86XK2 927 aa12.78□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 NECAB1Q8N987 351 aa12.78□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 PHKBQ93100 1093 aa12.78□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 TBC1D32Q96NH3 1257 aa12.78□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 ACAD9Q9H845 621 aa12.78□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 MCM3APO60318 1980 aa12.78□□□□□ -0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa12.77□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 SOWAHBA6NEL2 793 aa12.77□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 ADAMTS3O15072 1205 aa12.77□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 INHAP05111 366 aa12.77□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 ST3GAL1Q11201 340 aa12.77□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 IRF5Q13568 498 aa12.77□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 NTRK3Q16288 839 aa12.77□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa12.77□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 ANKRD35Q8N283 1001 aa12.77□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 CHST13Q8NET6 341 aa12.77□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 SOCS4Q8WXH5 440 aa12.77□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP12.77□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 DDX11Q96FC9 970 aa12.77□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 APBA2Q99767 749 aa12.77□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 SPZ1Q9BXG8 430 aa12.77□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 CYP39A1Q9NYL5 469 aa12.77□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 COL20A1Q9P218 1284 aa12.77□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 V9GY48 417 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa12.76□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 STRNO43815 780 aa12.76□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 IGHA2P01877 340 aa12.76□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 HOXC6P09630 235 aa12.76□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 CALML3P27482 149 aa12.76□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 PRMT2P55345 433 aa12.76□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 SCRN1Q12765 414 aa12.76□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 ME3Q16798 604 aa12.76□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 TYW1BQ6NUM6 668 aa12.76□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 TRPV1Q8NER1 839 aa12.76□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 SHISA4Q96DD7 197 aa12.76□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 MAML3Q96JK9 1138 aa12.76□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 ZNF333Q96JL9 665 aa12.76□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 AMNQ9BXJ7 453 aa12.76□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 UNC93B1Q9H1C4 597 aa12.76□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 RNF39Q9H2S5 420 aa12.76□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa12.76□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 NID2Q14112 1375 aa12.76□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 PTPDC1A2A3K4 754 aa12.75□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 CCDC85CA6NKD9 419 aa12.75□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 CAPN15O75808 1086 aa12.75□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 PTGS1P23219 599 aa12.75□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 COPB2P35606 906 aa12.75□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 GNAQP50148 359 aa12.75□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 TKFCQ3LXA3 575 aa12.75□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 WWC2Q6AWC2 1192 aa12.75□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 ABRAQ8N0Z2 381 aa12.75□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 FAM133AQ8N9E0 248 aa12.75□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 SLAIN1Q8ND83 568 aa12.75□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 ARMC5Q96C12 935 aa12.75□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 LZTS2Q9BRK4 669 aa12.75□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 FBXO40Q9UH90 709 aa12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.4 ms