RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 CHST13Q8NET6 341 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 GLT1D1Q96MS3 346 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 SPC25Q9HBM1 224 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 CTNNA3Q9UI47 895 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 STX8Q9UNK0 236 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 MYH4Q9Y623 1939 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 MOXD2PA6NHM9 499 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 FGAP02671 866 aa14.6□□□□□ -0.07
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PRAME-208ENST00000438888 CTDSPL2Q05D32 466 aa14.6□□□□□ -0.07
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PRAME-208ENST00000438888 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
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PRAME-208ENST00000438888 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa14.6□□□□□ -0.07
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PRAME-208ENST00000438888 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
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PRAME-208ENST00000438888 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 CDH23Q9H251 3354 aa14.59□□□□□ -0.07
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PRAME-208ENST00000438888 SLC27A2O14975 620 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 PTGS1P23219 599 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 CST5P28325 142 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 CCDC96Q2M329 555 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 FAM160B2Q86V87 743 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 CHURC1Q8WUH1 139 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 STAG1Q8WVM7 1258 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 KCNB2Q92953 911 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 TOX2Q96NM4 488 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 TRERF1Q96PN7 1200 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 TBX21Q9UL17 535 aa14.58□□□□□ -0.08
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PRAME-208ENST00000438888 ZNF536O15090 1300 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 SOWAHBA6NEL2 793 aa14.57□□□□□ -0.08
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PRAME-208ENST00000438888 TNFAIP2Q03169 654 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 EEPD1Q7L9B9 569 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 FAM133AQ8N9E0 248 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 GMCL1Q96IK5 515 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.086e-30■■□□□ 13.7
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PRAME-208ENST00000438888 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 TOMM22Q9NS69 142 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 ELP1O95163 1332 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 MROH7Q68CQ1 1323 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 ARVCFO00192 962 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 ZNF213O14771 459 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 CYP21A2P08686 494 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 FDX1P10109 184 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 ACRP10323 421 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 DNAJB2P25686 324 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 HAND2P61296 217 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 MUM1L1Q5H9M0 696 aa14.56□□□□□ -0.08
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PRAME-208ENST00000438888 MFSD5Q6N075 450 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 CXCL17Q6UXB2 119 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 NSMFQ6X4W1 530 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 TLK2Q86UE8 772 aa14.56□□□□□ -0.08
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PRAME-208ENST00000438888 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 IL17RBQ9NRM6 502 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 CCPG1Q9ULG6 757 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 PRR12Q9ULL5 1215 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 MCM3APO60318 1980 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 CTAGE5O15320 804 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 TLR3O15455 904 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 CSF2RAP15509 400 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 CDK7P50613 346 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 TSGA10IPQ3SY00 556 aa14.55□□□□□ -0.08
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