RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433119.5

HDAC11-211, Transcript of histone deacetylase 11, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HDAC11, Length 2,043 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11-211ENST00000433119 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
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HDAC11-211ENST00000433119 E2F4Q16254 413 aa23.48■■□□□ 1.35
HDAC11-211ENST00000433119 FAM83BQ5T0W9 1011 aa23.48■■□□□ 1.35
HDAC11-211ENST00000433119 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa23.48■■□□□ 1.35
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HDAC11-211ENST00000433119 USP17L18D6R9N7 530 aa23.47■■□□□ 1.35
HDAC11-211ENST00000433119 USP17L22D6RA61 530 aa23.47■■□□□ 1.35
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HDAC11-211ENST00000433119 USP17L19D6RCP7 530 aa23.47■■□□□ 1.35
HDAC11-211ENST00000433119 USP17L20D6RJB6 530 aa23.47■■□□□ 1.35
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HDAC11-211ENST00000433119 USH1GQ495M9 461 aa23.46■■□□□ 1.35
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HDAC11-211ENST00000433119 CCDC39Q9UFE4 941 aa23.46■■□□□ 1.35
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HDAC11-211ENST00000433119 SLC37A4O43826 429 aa23.45■■□□□ 1.34
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HDAC11-211ENST00000433119 PDXDC2PQ6P474 469 aa23.45■■□□□ 1.34
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HDAC11-211ENST00000433119 DPYDQ12882 1025 aa23.42■■□□□ 1.34
HDAC11-211ENST00000433119 GPC2Q8N158 579 aa23.42■■□□□ 1.34
HDAC11-211ENST00000433119 DISC1Q9NRI5 854 aa23.42■■□□□ 1.34
HDAC11-211ENST00000433119 SMC2O95347 1197 aa23.42■■□□□ 1.34
HDAC11-211ENST00000433119 TXKP42681 527 aa23.42■■□□□ 1.34
HDAC11-211ENST00000433119 CALCRLQ16602 461 aa23.42■■□□□ 1.34
HDAC11-211ENST00000433119 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.42■■□□□ 1.34
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HDAC11-211ENST00000433119 SPC24Q8NBT2 197 aa23.42■■□□□ 1.34
HDAC11-211ENST00000433119 KIFC2Q96AC6 838 aa23.42■■□□□ 1.34
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HDAC11-211ENST00000433119 CCSER1Q9C0I3 900 aa23.42■■□□□ 1.34
HDAC11-211ENST00000433119 EPS15P42566 896 aa23.41■■□□□ 1.34
HDAC11-211ENST00000433119 PPP4R3AQ6IN85 833 aa23.41■■□□□ 1.34
HDAC11-211ENST00000433119 CHURC1Q8WUH1 139 aa23.41■■□□□ 1.34
HDAC11-211ENST00000433119 AK8Q96MA6 479 aa23.41■■□□□ 1.34
HDAC11-211ENST00000433119 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
HDAC11-211ENST00000433119 OPLAHO14841 1288 aa23.4■■□□□ 1.34
HDAC11-211ENST00000433119 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
HDAC11-211ENST00000433119 STAT6P42226 847 aa23.4■■□□□ 1.34
HDAC11-211ENST00000433119 NAALADL2Q58DX5 795 aa23.4■■□□□ 1.34
HDAC11-211ENST00000433119 ZSCAN30Q86W11 494 aa23.4■■□□□ 1.34
HDAC11-211ENST00000433119 TRIML1Q8N9V2 468 aa23.4■■□□□ 1.34
HDAC11-211ENST00000433119 PLIN2Q99541 437 aa23.4■■□□□ 1.34
HDAC11-211ENST00000433119 FEZ1Q99689 392 aa23.4■■□□□ 1.34
HDAC11-211ENST00000433119 ANO3Q9BYT9 981 aa23.4■■□□□ 1.34
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