RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428858.1

TTC28-AS1-209, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 565 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HOMER1Q86YM7 354 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TEX2Q8IWB9 1127 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRIM22Q8IYM9 498 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CCDC82Q8N4S0 544 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NECAB1Q8N987 351 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CLEC4DQ8WXI8 215 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PHKBQ93100 1093 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ACAD9Q9H845 621 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RNF146Q9NTX7 359 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RLFQ13129 1914 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PTPDC1A2A3K4 754 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC15A5A6NIM6 579 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ALAS1P13196 640 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SCG2P13521 617 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PSMC4P43686 418 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRMT2P55345 433 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CAP1Q01518 475 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CUL4AQ13619 759 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GRB14Q14449 540 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ARHGEF6Q15052 776 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MORN1Q5T089 497 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 WWC2Q6AWC2 1192 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PPP1R18Q6NYC8 613 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PLEKHH3Q7Z736 793 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NCAPG2Q86XI2 1143 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SAMD3Q8N6K7 520 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RGS22Q8NE09 1264 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CD99L2Q8TCZ2 262 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SOCS4Q8WXH5 440 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRIM47Q96LD4 638 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRERF1Q96PN7 1200 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC26A6Q9BXS9 759 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BARHL2Q9NY43 387 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PFASO15067 1338 aa9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 STXBP3O00186 592 aa9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NFIBO00712 420 aa9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OPLAHO14841 1288 aa9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DEXIO95424 95 aa9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FCER1AP12319 257 aa9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PTPREP23469 700 aa9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LBX1P52954 281 aa9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KCTD2Q14681 263 aa9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 USH1GQ495M9 461 aa9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MUM1L1Q5H9M0 696 aa9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TYW1BQ6NUM6 668 aa9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MCF2L2Q86YR7 1114 aa9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CCDC83Q8IWF9 413 aa9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PIBF1Q8WXW3 757 aa9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 USP6NLQ92738 828 aa9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 COA7Q96BR5 231 aa9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRDM10Q9NQV6 1147 aa9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SH3GLB2Q9NR46 395 aa9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HOMER2Q9NSB8 354 aa9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CYP39A1Q9NYL5 469 aa9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GJD2Q9UKL4 321 aa9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MYH4Q9Y623 1939 aa9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa9.41□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ESYT2A0FGR8 921 aa9.41□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PIK3CDO00329 1044 aa9.41□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 JAK2O60674 1132 aa9.41□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HOXC6P09630 235 aa9.41□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FDPSP14324 419 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HOXD10P28358 340 aa9.41□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ADORA2AP29274 412 aa9.41□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HSD17B4P51659 736 aa9.41□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MAP2K5Q13163 448 aa9.41□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IRF5Q13568 498 aa9.41□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 WDR78Q5VTH9 848 aa9.41□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OTOP1Q7RTM1 612 aa9.41□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ANKRD35Q8N283 1001 aa9.41□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 WASF1Q92558 559 aa9.41□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP9.41□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MMP19Q99542 508 aa9.41□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NUDT12Q9BQG2 462 aa9.41□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SRRDQ9UH36 339 aa9.41□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PPFIA3O75145 1194 aa9.4□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IGHA2P01877 340 aa9.4□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RGS2P41220 211 aa9.4□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC4A3P48751 1232 aa9.4□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms