RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428678.1

UPK3BP1-201, Transcript of uroplakin 3B pseudogene 1, humanhuman

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Gene UPK3BP1, Length 509 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BP1-201ENST00000428678 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 SOWAHBA6NEL2 793 aa21.76■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 CABYRO75952 493 aa21.76■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 FGBP02675 491 aa21.76■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 ALAS1P13196 640 aa21.76■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC1A4P43007 532 aa21.76■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 TFAP4Q01664 338 aa21.76■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 GBF1Q92538 1859 aa21.76■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 THEGQ9P2T0 379 aa21.76■■□□□ 1.07
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UPK3BP1-201ENST00000428678 UMODL1Q5DID0 1318 aa21.76■■□□□ 1.07
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UPK3BP1-201ENST00000428678 IGFBP4P22692 258 aa21.75■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 PTGS1P23219 599 aa21.75■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 MCCP23508 829 aa21.75■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 ITGA7Q13683 1181 aa21.75■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 ADGRE1Q14246 886 aa21.75■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
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UPK3BP1-201ENST00000428678 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.75■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 OTOP2Q7RTS6 562 aa21.75■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC43A3Q8NBI5 491 aa21.75■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 STAG1Q8WVM7 1258 aa21.75■■□□□ 1.07
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UPK3BP1-201ENST00000428678 GMCL1Q96IK5 515 aa21.75■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 TRERF1Q96PN7 1200 aa21.75■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa21.75■■□□□ 1.07
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UPK3BP1-201ENST00000428678 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF536O15090 1300 aa21.75■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 LRRC37A2A6NM11 1700 aa21.75■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZEB2O60315 1214 aa21.74■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 CCL23P55773 120 aa21.74■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 SNAP25P60880 206 aa21.74■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 NAPBQ9H115 298 aa21.74■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 TRPV6Q9H1D0 765 aa21.74■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC28A3Q9HAS3 691 aa21.74■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 SMPD1P17405 629 aa21.73■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 PPARAQ07869 468 aa21.73■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 KCTD1Q719H9 257 aa21.73■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 EEPD1Q7L9B9 569 aa21.73■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
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UPK3BP1-201ENST00000428678 TRANK1O15050 2925 aa21.73■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 GRIN2DO15399 1336 aa21.73■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 REV3LO60673 3130 aa21.72■■□□□ 1.07
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UPK3BP1-201ENST00000428678 DCTPP1Q9H773 170 aa21.72■■□□□ 1.07
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UPK3BP1-201ENST00000428678 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
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UPK3BP1-201ENST00000428678 MUM1L1Q5H9M0 696 aa21.71■■□□□ 1.07
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UPK3BP1-201ENST00000428678 IQSEC1Q6DN90 963 aa21.71■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 NSMFQ6X4W1 530 aa21.71■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa21.71■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 CYP39A1Q9NYL5 469 aa21.71■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 MTMR7Q9Y216 660 aa21.71■■□□□ 1.07
UPK3BP1-201ENST00000428678 TSPY2A6NKD2 308 aa21.7■■□□□ 1.06
UPK3BP1-201ENST00000428678 PLA2G6O60733 806 aa21.7■■□□□ 1.06
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UPK3BP1-201ENST00000428678 IL27Q8NEV9 243 aa21.7■■□□□ 1.06
UPK3BP1-201ENST00000428678 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa21.7■■□□□ 1.06
UPK3BP1-201ENST00000428678 FSD1Q9BTV5 496 aa21.7■■□□□ 1.06
UPK3BP1-201ENST00000428678 WNT8AQ9H1J5 351 aa21.7■■□□□ 1.06
UPK3BP1-201ENST00000428678 CCPG1Q9ULG6 757 aa21.7■■□□□ 1.06
UPK3BP1-201ENST00000428678 PRR12Q9ULL5 1215 aa21.7■■□□□ 1.06
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa21.7■■□□□ 1.06
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZBBXA8MT70 800 aa21.69■■□□□ 1.06
UPK3BP1-201ENST00000428678 COL9A1P20849 921 aa21.69■■□□□ 1.06
UPK3BP1-201ENST00000428678 TMEM63BQ5T3F8 832 aa21.69■■□□□ 1.06
UPK3BP1-201ENST00000428678 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.69■■□□□ 1.06
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UPK3BP1-201ENST00000428678 LCTP09848 1927 aa21.68■■□□□ 1.06
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UPK3BP1-201ENST00000428678 CCDC96Q2M329 555 aa21.68■■□□□ 1.06
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UPK3BP1-201ENST00000428678 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
UPK3BP1-201ENST00000428678 SCLYQ96I15 445 aa21.68■■□□□ 1.06
UPK3BP1-201ENST00000428678 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
UPK3BP1-201ENST00000428678 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP21.68■■□□□ 1.06
UPK3BP1-201ENST00000428678 XIRP2A4UGR9 3374 aa21.67■■□□□ 1.06
UPK3BP1-201ENST00000428678 TTC41PQ6P2S7 1318 aa21.67■■□□□ 1.06
UPK3BP1-201ENST00000428678 ERC2O15083 957 aa21.67■■□□□ 1.06
UPK3BP1-201ENST00000428678 CTDSPL2Q05D32 466 aa21.67■■□□□ 1.06
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.67■■□□□ 1.06
UPK3BP1-201ENST00000428678 MICALL1Q8N3F8 863 aa21.67■■□□□ 1.06
UPK3BP1-201ENST00000428678 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
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