RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 C8orf76Q96K31 380 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 ABCB11O95342 1321 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 TRIM29Q14134 588 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 FAM110CQ1W6H9 321 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC148Q8NFR7 591 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 TRPA1O75762 1119 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 Q3C1V9 767 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 TYW1BQ6NUM6 668 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 RIOX2Q8IUF8 465 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 SH3GLB2Q9NR46 395 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 GJB4Q9NTQ9 266 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 RNF186Q9NXI6 227 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 MORF4L1Q9UBU8 362 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 RIPK3Q9Y572 518 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 MGAMO43451 1857 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 PLXNB2O15031 1838 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 CCNA1P78396 465 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 PPP1R18Q6NYC8 613 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 TRERF1Q96PN7 1200 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 RNF146Q9NTX7 359 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 BCRP11274 1271 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 PDCP20941 246 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 TKFCQ3LXA3 575 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 NCAPG2Q86XI2 1143 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 TBC1D8O95759 1140 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 SLC25A27O95847 323 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 NLRP5P59047 1200 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 GUCY1B3Q02153 619 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 C17orf99Q6UX52 265 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 SHISA4Q96DD7 197 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 KCNJ14Q9UNX9 436 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 H3BQV1 296 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 FOXN1O15353 648 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 ERCC3P19447 782 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 COPB2P35606 906 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 IFFO2Q5TF58 517 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 WDR78Q5VTH9 848 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 KRT40Q6A162 431 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 ACAD9Q9H845 621 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 SMCO2A6NFE2 343 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 ADCY7P51828 1080 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 MUM1L1Q5H9M0 696 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 CHST13Q8NET6 341 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 C6orf50Q9HD87 102 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 DOCK3Q8IZD9 2030 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 ESYT2A0FGR8 921 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 NFIBO00712 420 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 SYT1P21579 422 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 SHCBP1Q8NEM2 672 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 CLEC4DQ8WXI8 215 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 CUL5Q93034 780 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 PHF20Q9BVI0 1012 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 CFHR5Q9BXR6 569 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 ZMYND12Q9H0C1 365 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 PORCNQ9H237 461 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 PSTPIP2Q9H939 334 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 FBXO40Q9UH90 709 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 CALML3P27482 149 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 GNA11P29992 359 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 MROH8Q9H579 483 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 EFCC1Q9HA90 598 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 SAGE1Q9NXZ1 904 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 OPLAHO14841 1288 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 MMP1P03956 469 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 NSMFQ6X4W1 530 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 MCF2L2Q86YR7 1114 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 CFBP00751 764 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP23.65■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 GLT8D2Q9H1C3 349 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 BRMS1Q9HCU9 246 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 RIC8AQ9NPQ8 531 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 PCDHA4Q9UN74 947 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 LCTP09848 1927 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 STX6O43752 255 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 GALNT17Q6IS24 598 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 BICD2Q8TD16 824 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXA4-202ENST00000428284 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 POLR2MP0CAP2 368 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 MAPK4P31152 587 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 KRT2P35908 639 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 RNF207Q6ZRF8 634 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 BLIDQ8IZY5 108 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 ANKRD35Q8N283 1001 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.8 ms