RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP19.83■□□□□ 0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KCNH6Q9H252 994 aa19.83■□□□□ 0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C1orf115Q9H7X2 142 aa19.83■□□□□ 0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FEM1BQ9UK73 627 aa19.83■□□□□ 0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ALADP13716 330 aa19.82■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMPD1P17405 629 aa19.82■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP19.82■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ACAD9Q9H845 621 aa19.82■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CD320Q9NPF0 282 aa19.82■□□□□ 0.76
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADD2P35612 726 aa19.81■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa19.81■□□□□ 0.76
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 CTR9Q6PD62 1173 aa19.81■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GJD3Q8N144 294 aa19.81■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SNX27Q96L92 541 aa19.81■□□□□ 0.76
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 BAIAP3O94812 1187 aa19.8■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CYP2C9P11712 490 aa19.8■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa19.8■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM178BQ8IXR5 827 aa19.8■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UIMC1Q96RL1 719 aa19.8■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa19.8■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa19.8■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa19.8■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZBED9Q6R2W3 1325 aa19.79■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SOWAHBA6NEL2 793 aa19.79■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PITPNM1O00562 1244 aa19.79■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RETREG2Q8NC44 543 aa19.79■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP19.79■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MKNK2Q9HBH9 465 aa19.79■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLIP2Q9UDT6 1046 aa19.79■□□□□ 0.76
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARHGEF15O94989 841 aa19.78■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NHLH1Q02575 133 aa19.78■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TKFCQ3LXA3 575 aa19.78■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LEXMQ3ZCV2 418 aa19.78■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa19.78■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VTA1Q9NP79 307 aa19.78■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PAG1Q9NWQ8 432 aa19.78■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 TAPT1Q6NXT6 567 aa19.77■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RHPN1Q8TCX5 695 aa19.77■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MKL1Q969V6 931 aa19.77■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PDGFCQ9NRA1 345 aa19.77■□□□□ 0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RNF146Q9NTX7 359 aa19.77■□□□□ 0.76
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 CPT1AP50416 773 aa19.76■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BFSP2Q13515 415 aa19.76■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBE3CQ15386 1083 aa19.76■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DUSP28Q4G0W2 176 aa19.76■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CEP85Q6P2H3 762 aa19.76■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa19.76■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa19.76■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF536O15090 1300 aa19.76■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PURAQ00577 322 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SBK1Q52WX2 424 aa19.75■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EEPD1Q7L9B9 569 aa19.75■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZBED2Q9BTP6 218 aa19.75■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF287Q9HBT7 754 aa19.75■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BMP3P12645 472 aa19.74■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTGS1P23219 599 aa19.74■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STAT2P52630 851 aa19.74■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLFNL1Q499Z3 407 aa19.74■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM47CQ5HY64 1035 aa19.74■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa19.74■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NFRKBQ6P4R8 1299 aa19.74■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ITPRIPQ8IWB1 547 aa19.74■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GDPD5Q8WTR4 605 aa19.74■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHURC1Q8WUH1 139 aa19.74■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRERF1Q96PN7 1200 aa19.74■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa19.73■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TTLL1O95922 423 aa19.73■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MYL3P08590 195 aa19.73■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM160B2Q86V87 743 aa19.73■□□□□ 0.75
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