RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417058.6

CD27-AS1-202, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD27-AS1, Length 1,497 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-202ENST00000417058 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa11.38□□□□□ -0.59
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CD27-AS1-202ENST00000417058 GHRHRQ02643 423 aa11.35□□□□□ -0.59
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CD27-AS1-202ENST00000417058 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP11.35□□□□□ -0.59
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CD27-AS1-202ENST00000417058 RIOX2Q8IUF8 465 aa11.35□□□□□ -0.59
CD27-AS1-202ENST00000417058 BLIDQ8IZY5 108 aa11.35□□□□□ -0.59
CD27-AS1-202ENST00000417058 OXER1Q8TDS5 423 aa11.35□□□□□ -0.59
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CD27-AS1-202ENST00000417058 ERVK-9P63128 1117 aa11.34□□□□□ -0.59
CD27-AS1-202ENST00000417058 ERVK-24P63145 666 aa11.34□□□□□ -0.59
CD27-AS1-202ENST00000417058 NR5A1Q13285 461 aa11.34□□□□□ -0.59
CD27-AS1-202ENST00000417058 PLS1Q14651 629 aa11.34□□□□□ -0.59
CD27-AS1-202ENST00000417058 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
CD27-AS1-202ENST00000417058 MUM1L1Q5H9M0 696 aa11.34□□□□□ -0.59
CD27-AS1-202ENST00000417058 MCTP1Q6DN14 999 aa11.34□□□□□ -0.59
CD27-AS1-202ENST00000417058 FERMT3Q86UX7 667 aa11.34□□□□□ -0.59
CD27-AS1-202ENST00000417058 BICD2Q8TD16 824 aa11.34□□□□□ -0.59
CD27-AS1-202ENST00000417058 TRERF1Q96PN7 1200 aa11.34□□□□□ -0.59
CD27-AS1-202ENST00000417058 PAGR1Q9BTK6 254 aa11.34□□□□□ -0.59
CD27-AS1-202ENST00000417058 MAF1Q9H063 256 aa11.34□□□□□ -0.59
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