RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP8.42□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 GRM1Q13255 1194 aa8.42□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 PDZD3Q86UT5 571 aa8.42□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 CCDC146Q8IYE0 955 aa8.42□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.42□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 POLKQ9UBT6 870 aa8.42□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 SCN4AP35499 1836 aa8.41□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa8.41□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 TM4SF1P30408 202 aa8.41□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 RRP1P56182 461 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 ID3Q02535 119 aa8.41□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 ATXN3LQ9H3M9 355 aa8.41□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 DISC1Q9NRI5 854 aa8.41□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 RCAN3Q9UKA8 241 aa8.41□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 CARMIL3Q8ND23 1372 aa8.4□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 IL16Q14005 1332 aa8.4□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa8.4□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 AMPHP49418 695 aa8.4□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 SLFN5Q08AF3 891 aa8.4□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 WDR63Q8IWG1 891 aa8.4□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 TTLL6Q8N841 843 aa8.4□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 PLEKHF1Q96S99 279 aa8.4□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 NEFMP07197 916 aa8.39□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 SLFN14P0C7P3 912 aa8.39□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 IL13P35225 146 aa8.39□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 CYP27C1Q4G0S4 372 aa8.39□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 OGFOD2Q6N063 350 aa8.39□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 CNTROBQ8N137 903 aa8.39□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 STK11IPQ8N1F8 1099 aa8.39□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 ASIC4Q96FT7 647 aa8.39□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 TRAIPQ9BWF2 469 aa8.39□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 TMOD3Q9NYL9 352 aa8.39□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 SLC5A6Q9Y289 635 aa8.39□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 NRXN2Q9P2S2 1712 aa8.39□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 ZNF831Q5JPB2 1677 aa8.38□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 LCE4AQ5TA78 99 aa8.38□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa8.38□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 SPRED2Q7Z698 418 aa8.38□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 MISP3Q96FF7 219 aa8.38□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 MYH16Q9H6N6 1097 aa8.38□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.38□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 ZNF541Q9H0D2 1346 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 IQCA1LA6NCM1 817 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 SOWAHDA6NJG2 315 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 LMOD3Q0VAK6 560 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 CDK5R2Q13319 367 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 CST9Q5W186 159 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 PI16Q6UXB8 463 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 DTHD1Q6ZMT9 781 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 TMC7Q7Z402 723 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 C2CD5Q86YS7 1000 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 POU5F2Q8N7G0 328 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 PIDD1Q9HB75 910 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 LGR6Q9HBX8 967 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 PPP4R2Q9NY27 417 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 COL6A3P12111 3177 aa8.36□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 PAPLNO95428 1278 aa8.36□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 FAM87AP0C7U9 286 aa8.36□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 PRKAR2BP31323 418 aa8.36□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 TMPOP42166 694 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 CRKLP46109 303 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 DSC3Q14574 896 aa8.36□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 TTLL4Q14679 1199 aa8.36□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 NFIXQ14938 502 aa8.36□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa8.36□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 MKNK2Q9HBH9 465 aa8.36□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 U3KQE9 123 aa8.36□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 TRPM7Q96QT4 1865 aa8.36□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 NCAPD2Q15021 1401 aa8.36□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 SLX4Q8IY92 1834 aa8.36□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 LTBP3Q9NS15 1303 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 CACNA1SQ13698 1873 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 TRAF5O00463 557 aa8.35□□□□□ -1.07
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