RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399207.5

SETD4-204, Transcript of SET domain containing 4, human

TSL 3 BASIC

Gene SETD4, Length 1,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SETD4-204	ENST00000399207	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		12.79	□□□□□ -0.36
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SETD4-204	ENST00000399207		E7EWF7	191 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SETD4-204	ENST00000399207	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SETD4-204	ENST00000399207	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SETD4-204	ENST00000399207	PYGB	P11216	843 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SETD4-204	ENST00000399207	AKR1A1	P14550	325 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SETD4-204	ENST00000399207	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SETD4-204	ENST00000399207	ANO1	Q5XXA6	986 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SETD4-204	ENST00000399207	NSMF	Q6X4W1	530 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SETD4-204	ENST00000399207	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SETD4-204	ENST00000399207	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SETD4-204	ENST00000399207	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SETD4-204	ENST00000399207	MCM3AP	O60318	1980 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SETD4-204	ENST00000399207	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SETD4-204	ENST00000399207	GABBR2	O75899	941 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SETD4-204	ENST00000399207	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SETD4-204	ENST00000399207	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SETD4-204	ENST00000399207	COL6A1	P12109	1028 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SETD4-204	ENST00000399207	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SETD4-204	ENST00000399207	CNTN2	Q02246	1040 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SETD4-204	ENST00000399207	ACVR2B	Q13705	512 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SETD4-204	ENST00000399207	SEC23A	Q15436	765 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SETD4-204	ENST00000399207	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SETD4-204	ENST00000399207	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SETD4-204	ENST00000399207	RNF180	Q86T96	592 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SETD4-204	ENST00000399207	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SETD4-204	ENST00000399207	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SETD4-204	ENST00000399207	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SETD4-204	ENST00000399207	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SETD4-204	ENST00000399207	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SETD4-204	ENST00000399207	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SETD4-204	ENST00000399207	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SETD4-204	ENST00000399207	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SETD4-204	ENST00000399207	MAP3K13	O43283	966 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	CDC45	O75419	566 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	WTAP	Q15007	396 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	RNF20	Q5VTR2	975 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	ARMCX2	Q7L311	632 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	SKAP1	Q86WV1	359 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	MYH6	P13533	1939 aa		12.77	□□□□□ -0.37
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SETD4-204	ENST00000399207	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	LRRC41	Q15345	812 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
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SETD4-204	ENST00000399207	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	MTA3	Q9BTC8	594 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	MAF1	Q9H063	256 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	SPC25	Q9HBM1	224 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	ALPK3	Q96L96	1907 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207		B4DLN1	442 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	KLRF2	D3W0D1	207 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	NFIB	O00712	420 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
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SETD4-204	ENST00000399207	FGD4	Q96M96	766 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	CPVL	Q9H3G5	476 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	SLC27A2	O14975	620 aa		12.74	□□□□□ -0.37
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SETD4-204	ENST00000399207	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
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SETD4-204	ENST00000399207	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	RGS22	Q8NE09	1264 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	TMEM87B	Q96K49	555 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
SETD4-204	ENST00000399207	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37

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