RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 CLIC6Q96NY7 704 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 SIRT5Q9NXA8 310 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF180Q9UJW8 692 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 CEP131Q9UPN4 1083 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 PLCH1Q4KWH8 1693 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 RPS6KA5O75582 802 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 RECKO95980 971 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 LINGO3P0C6S8 592 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 NR2C2P49116 596 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 PMS2P54278 862 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 OSBPL9Q96SU4 736 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 TCF12Q99081 682 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 KDRP35968 1356 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 MAP3K13O43283 966 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 PRC1O43663 620 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 COPAP53621 1224 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 CD83Q01151 205 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 NUCB1Q02818 461 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 NEK5Q6P3R8 708 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP6V0A1Q93050 837 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 CCT7Q99832 543 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 HTR3EA5X5Y0 456 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 ZMYND10O75800 440 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 HSPA1LP34931 641 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 TCERG1LQ5VWI1 586 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 C1orf228Q6PIY5 440 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 LRSAM1Q6UWE0 723 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 ARHGAP18Q8N392 663 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 PSKH2Q96QS6 385 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 C1orf167Q5SNV9 1468 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 GOLGA6L10A6NI86 522 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 B4DLN1 442 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 EVI5O60447 810 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 UBA7P41226 1012 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 TMTC4Q5T4D3 741 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 TMC4Q7Z404 712 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 GALNT15Q8N3T1 639 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 PANK1Q8TE04 598 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 RUNDC1Q96C34 613 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 UQCC2Q9BRT2 126 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 HEY1Q9Y5J3 304 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 TACC1O75410 805 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 WEE1P30291 646 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 TUBA1BP68363 451 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 C6orf183Q5T699 404 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 NUGGCQ68CJ6 796 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 ADALQ6DHV7 355 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 TUBA1AQ71U36 451 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 GALNT6Q8NCL4 622 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 NXPE3Q969Y0 559 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 C19orf44Q9H6X5 657 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 RIC8AQ9NPQ8 531 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 TTC34A8MYJ7 566 aa7.57□□□□□ -1.2
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RABGEF1-202ENST00000380828 SNX2O60749 519 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 MXI1P50539 228 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 GNAI1P63096 354 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 KLHL30Q0D2K2 578 aa7.57□□□□□ -1.2
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RABGEF1-202ENST00000380828 EXOC3L1Q86VI1 746 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 TCEANC2Q96MN5 208 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 ZWILCHQ9H900 591 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 METP08581 1390 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 AKAP12Q02952 1782 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 GOLGA8AA7E2F4 631 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
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