RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 TRIM29Q14134 588 aa32■■■□□ 2.71
GIPC1-201ENST00000345425 RNF186Q9NXI6 227 aa32■■■□□ 2.71
GIPC1-201ENST00000345425 CPA4Q9UI42 421 aa32■■■□□ 2.71
GIPC1-201ENST00000345425 PEX10O60683 326 aa31.99■■■□□ 2.71
GIPC1-201ENST00000345425 BCRP11274 1271 aa31.99■■■□□ 2.71
GIPC1-201ENST00000345425 PDCP20941 246 aa31.99■■■□□ 2.71
GIPC1-201ENST00000345425 C17orf99Q6UX52 265 aa31.99■■■□□ 2.71
GIPC1-201ENST00000345425 C8orf76Q96K31 380 aa31.99■■■□□ 2.71
GIPC1-201ENST00000345425 VPS54Q9P1Q0 977 aa31.99■■■□□ 2.71
GIPC1-201ENST00000345425 Q3C1V9 767 aa31.99■■■□□ 2.71
GIPC1-201ENST00000345425 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa31.99■■■□□ 2.71
GIPC1-201ENST00000345425 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
GIPC1-201ENST00000345425 TRPA1O75762 1119 aa31.98■■■□□ 2.71
GIPC1-201ENST00000345425 TRERF1Q96PN7 1200 aa31.98■■■□□ 2.71
GIPC1-201ENST00000345425 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
GIPC1-201ENST00000345425 SHCBP1Q8NEM2 672 aa31.97■■■□□ 2.71
GIPC1-201ENST00000345425 CHST13Q8NET6 341 aa31.97■■■□□ 2.71
GIPC1-201ENST00000345425 HOMER2Q9NSB8 354 aa31.97■■■□□ 2.71
GIPC1-201ENST00000345425 RNF146Q9NTX7 359 aa31.97■■■□□ 2.71
GIPC1-201ENST00000345425 SAGE1Q9NXZ1 904 aa31.97■■■□□ 2.71
GIPC1-201ENST00000345425 RIPK3Q9Y572 518 aa31.97■■■□□ 2.71
GIPC1-201ENST00000345425 SMCHD1A6NHR9 2005 aa31.97■■■□□ 2.71
GIPC1-201ENST00000345425 TYW1BQ6NUM6 668 aa31.96■■■□□ 2.71
GIPC1-201ENST00000345425 BEGAINQ9BUH8 593 aa31.96■■■□□ 2.71
GIPC1-201ENST00000345425 FBXO40Q9UH90 709 aa31.96■■■□□ 2.71
GIPC1-201ENST00000345425 ESYT2A0FGR8 921 aa31.96■■■□□ 2.71
GIPC1-201ENST00000345425 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP31.96■■■□□ 2.71
GIPC1-201ENST00000345425 NCAPG2Q86XI2 1143 aa31.96■■■□□ 2.71
GIPC1-201ENST00000345425 RGS22Q8NE09 1264 aa31.96■■■□□ 2.71
GIPC1-201ENST00000345425 ACAD9Q9H845 621 aa31.96■■■□□ 2.71
GIPC1-201ENST00000345425 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP31.95■■■□□ 2.71
GIPC1-201ENST00000345425 GLT8D2Q9H1C3 349 aa31.95■■■□□ 2.71
GIPC1-201ENST00000345425 MROH8Q9H579 483 aa31.95■■■□□ 2.71
GIPC1-201ENST00000345425 FOSBP53539 338 aa31.94■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 NLRP5P59047 1200 aa31.94■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 MCF2L2Q86YR7 1114 aa31.94■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 ZMYND12Q9H0C1 365 aa31.94■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 C6orf50Q9HD87 102 aa31.94■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 SMCO2A6NFE2 343 aa31.94■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 TBC1D8O95759 1140 aa31.94■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 ERCC3P19447 782 aa31.94■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 CALML3P27482 149 aa31.94■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 GNA11P29992 359 aa31.94■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa31.94■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 PHF20Q9BVI0 1012 aa31.94■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 KRT40Q6A162 431 aa31.93■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 GALNT17Q6IS24 598 aa31.93■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 PSTPIP2Q9H939 334 aa31.93■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 GJB4Q9NTQ9 266 aa31.93■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 H3BQV1 296 aa31.92■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 ADCY7P51828 1080 aa31.92■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 MUM1L1Q5H9M0 696 aa31.92■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 IFFO2Q5TF58 517 aa31.92■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 TEX2Q8IWB9 1127 aa31.92■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 CLEC4DQ8WXI8 215 aa31.92■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 CUL5Q93034 780 aa31.92■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 SHISA4Q96DD7 197 aa31.92■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 MAF1Q9H063 256 aa31.92■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
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GIPC1-201ENST00000345425 BICD2Q8TD16 824 aa31.91■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 PORCNQ9H237 461 aa31.91■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa31.91■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 RIC8AQ9NPQ8 531 aa31.91■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 KCNJ14Q9UNX9 436 aa31.91■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 NFIBO00712 420 aa31.91■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 MAPK4P31152 587 aa31.91■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 BRMS1Q9HCU9 246 aa31.91■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 MMP1P03956 469 aa31.9■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 SYT1P21579 422 aa31.9■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 WDR78Q5VTH9 848 aa31.9■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 EFCC1Q9HA90 598 aa31.9■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 OPLAHO14841 1288 aa31.89■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 GUCY1B3Q02153 619 aa31.89■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP31.89■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP31.89■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 PCDHA4Q9UN74 947 aa31.89■■■□□ 2.7
GIPC1-201ENST00000345425 DAGLBQ8NCG7 672 aa31.89■■■□□ 2.69
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GIPC1-201ENST00000345425 GHRHRQ02643 423 aa31.87■■■□□ 2.69
GIPC1-201ENST00000345425 ANKRD35Q8N283 1001 aa31.87■■■□□ 2.69
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GIPC1-201ENST00000345425 PIK3CDO00329 1044 aa31.86■■■□□ 2.69
GIPC1-201ENST00000345425 RNF207Q6ZRF8 634 aa31.86■■■□□ 2.69
GIPC1-201ENST00000345425 BLIDQ8IZY5 108 aa31.86■■■□□ 2.69
GIPC1-201ENST00000345425 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP31.86■■■□□ 2.69
GIPC1-201ENST00000345425 STRNO43815 780 aa31.86■■■□□ 2.69
GIPC1-201ENST00000345425 FCER1AP12319 257 aa31.86■■■□□ 2.69
GIPC1-201ENST00000345425 KRT2P35908 639 aa31.86■■■□□ 2.69
GIPC1-201ENST00000345425 SP3Q02447 781 aa31.86■■■□□ 2.69
GIPC1-201ENST00000345425 KCTD2Q14681 263 aa31.86■■■□□ 2.69
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