RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329078.7

SPNS2-201, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS2, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-201ENST00000329078 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SPNS2-201ENST00000329078 CDKAL1Q5VV42 579 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS2-201ENST00000329078 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SPNS2-201ENST00000329078 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SPNS2-201ENST00000329078 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS2-201ENST00000329078 MICALL1Q8N3F8 863 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS2-201ENST00000329078 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SPNS2-201ENST00000329078 KCND1Q9NSA2 647 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS2-201ENST00000329078 RWDD2AQ9UIY3 292 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS2-201ENST00000329078 PTPROQ16827 1216 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 HDXQ7Z353 690 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 OR8K1Q8NGG5 319 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 SPEF2Q9C093 1822 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 MYH7P12883 1935 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 ERLIN1O75477 346 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 SLIT2O94813 1529 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 SLC16A2P36021 539 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 STK4Q13043 487 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 CEP112Q8N8E3 955 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 TBCKQ8TEA7 893 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 EXOC4Q96A65 974 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 NYXQ9GZU5 481 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 NDUFA10O95299 355 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 CXCR5P32302 372 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 SPATA20Q8TB22 786 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 C12orf60Q5U649 245 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 CNBD1Q8NA66 436 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC148Q8NFR7 591 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC151A5D8V7 595 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 LONP1P36776 959 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 TNFRSF25Q93038 417 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 POTEMA6NI47 508 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF185O15231 689 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 CASP8Q14790 479 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 CRACR2AQ9BSW2 395 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 MYO6Q9UM54 1294 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 PACS2Q86VP3 889 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 NUP98P52948 1817 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 USP17L5A8MUK1 530 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 ORC4O43929 436 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 SCNN1DP51172 638 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 CALML4Q96GE6 196 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 NLRC4Q9NPP4 1024 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 UBE2SQ16763 222 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 POTEDQ86YR6 584 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 MB21D1Q8N884 522 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 FAM212AQ96EL1 285 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 JAKMIP2Q96AA8 810 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC42Q96M95 316 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 H7C1D1 291 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 AKR1B10O60218 316 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 LIG3P49916 1009 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 GTF2IP78347 998 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 CEP95Q96GE4 821 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 C6orf50Q9HD87 102 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 OR52Z1P0C646 297 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 C4AP0C0L4 1744 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 C4BP0C0L5 1744 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 FAM196BA6NMK8 535 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 CDK8P49336 464 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 GNAQP50148 359 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 RCAN1P53805 252 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 MXD3Q9BW11 206 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 SPA17Q15506 151 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.15■■□□□ 1.14
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