RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 ZNF662Q6ZS27 426 aa28.24■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 FAM76AQ8TAV0 307 aa28.24■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa28.24■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 KCNB1Q14721 858 aa28.23■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 KBTBD4Q9NVX7 518 aa28.23■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 MTMR7Q9Y216 660 aa28.23■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 ZNF804BA4D1E1 1349 aa28.23■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 MOCS3O95396 460 aa28.23■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 IRAK1P51617 712 aa28.23■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 ZBED6P86452 979 aa28.23■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 SLC35G1Q2M3R5 365 aa28.23■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa28.23■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 BCL9O00512 1426 aa28.23■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 CCDC96Q2M329 555 aa28.22■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 EHBP1Q8NDI1 1231 aa28.22■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 UBA7P41226 1012 aa28.22■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 NFRKBQ6P4R8 1299 aa28.22■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 C3orf67Q6ZVT6 689 aa28.22■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 SNX12Q9UMY4 172 aa28.22■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 EXOC5O00471 708 aa28.22■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 KLRK1P26718 216 aa28.22■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 VAV2P52735 878 aa28.22■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 KIF5AQ12840 1032 aa28.22■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 CCDC178Q5BJE1 867 aa28.22■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 ANO9A1A5B4 782 aa28.21■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 ERCC3P19447 782 aa28.21■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 PCDHA4Q9UN74 947 aa28.21■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 NCK2O43639 380 aa28.21■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 P2RX5Q93086 422 aa28.21■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 POLD4Q9HCU8 107 aa28.21■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa28.21■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 FAM184BQ9ULE4 1060 aa28.21■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 PCDHA6Q9UN73 950 aa28.21■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa28.21■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 PLCG1P19174 1290 aa28.2■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 CCDC170Q8IYT3 715 aa28.2■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 M0R2N6 131 aa28.2■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 PDE4DQ08499 809 aa28.2■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 PPM1EQ8WY54 764 aa28.2■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 TSPY2A6NKD2 308 aa28.19■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 ICE2Q659A1 982 aa28.19■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa28.19■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 ARL8AQ96BM9 186 aa28.19■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 CCDC42Q96M95 316 aa28.19■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 SALL4Q9UJQ4 1053 aa28.19■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 JAG2Q9Y219 1238 aa28.19■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 DLEC1Q9Y238 1755 aa28.19■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa28.19■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 SPATA4Q8NEY3 305 aa28.19■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 JRKLQ9Y4A0 524 aa28.19■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 A0A0G2JS52 829 aa28.18■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 NTSR2O95665 410 aa28.18■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 C2CD5Q86YS7 1000 aa28.18■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP28.18■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 GRIN2DO15399 1336 aa28.18■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 ORC4O43929 436 aa28.18■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 CCNE1P24864 410 aa28.18■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 ATP2B2Q01814 1243 aa28.18■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 MICALL1Q8N3F8 863 aa28.18■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 MMGT1Q8N4V1 131 aa28.18■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa28.18■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 FLT1P17948 1338 aa28.17■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 NUP58Q9BVL2 599 aa28.17■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 MECOMQ03112 1051 aa28.17■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 TXNRD1Q16881 649 aa28.17■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 TADA2BQ86TJ2 420 aa28.17■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 CPVLQ9H3G5 476 aa28.17■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 SH2D4AQ9H788 454 aa28.17■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 IL17RBQ9NRM6 502 aa28.17■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 TAF1P21675 1872 aa28.16■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 CALML3P27482 149 aa28.16■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 LIG3P49916 1009 aa28.16■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 KAT2BQ92831 832 aa28.16■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 OSBPL9Q96SU4 736 aa28.16■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 TRIM9Q9C026 710 aa28.16■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 GNGT1P63211 74 aa28.16■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 ASIC1P78348 528 aa28.16■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 SPA17Q15506 151 aa28.16■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 TTMPQ5BVD1 217 aa28.16■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 EFCAB13Q8IY85 973 aa28.16■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 CAPS2Q9BXY5 557 aa28.16■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 CCSER1Q9C0I3 900 aa28.16■■■□□ 2.1
SENP3-201ENST00000321337 SEMA6BQ9H3T3 888 aa28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms