RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 RABGGTAQ92696 567 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 TRIM47Q96LD4 638 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 PLCG1P19174 1290 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 KRT9P35527 623 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 TXNRD1Q16881 649 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 MB21D1Q8N884 522 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 GOLGA1Q92805 767 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 POLLQ9UGP5 575 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 CREBRFQ8IUR6 639 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 FAM114A1Q8IWE2 563 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 EXOC1Q9NV70 894 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 DNM2P50570 870 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 COBLL1Q53SF7 1204 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 TTI2Q6NXR4 508 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 CALML4Q96GE6 196 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 PIGSQ96S52 555 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 TRIM9Q9C026 710 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 ERVK-24P63145 666 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 CEP112Q8N8E3 955 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 OR8K1Q8NGG5 319 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 TBCKQ8TEA7 893 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 MYH1P12882 1939 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 TRIM49BA6NDI0 452 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 C6orf229H3BNL8 230 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 PDHBP11177 359 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 CCNE1P24864 410 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF507Q8TCN5 953 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 MTMR4Q9NYA4 1195 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 CDC23Q9UJX2 597 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 CTAGE9A4FU28 777 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 FAM193AP78312 1265 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF569Q5MCW4 686 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 SP8Q8IXZ3 490 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 RETREG2Q8NC44 543 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 NUP58Q9BVL2 599 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 COA1Q9GZY4 146 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 CPVLQ9H3G5 476 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 VAT1LQ9HCJ6 419 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 USP17L5A8MUK1 530 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 PDE4DQ08499 809 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 PPP1R18Q6NYC8 613 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 CNNM4Q6P4Q7 775 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 P2RX5Q93086 422 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 PLIN2Q99541 437 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 RAB34Q9BZG1 259 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 CAPN11Q9UMQ6 739 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 FHOD1Q9Y613 1164 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 MYO3BQ8WXR4 1341 aa21.92■■□□□ 1.1
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SPNS1-201ENST00000311008 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 DNAJC7Q99615 494 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 STK17AQ9UEE5 414 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 SWAP70Q9UH65 585 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 C10orf71Q711Q0 1435 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 SNHG28P0DPA3 235 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 TECP42680 631 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 ASIC1P78348 528 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM266Q2M3C6 531 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 FOCADQ5VW36 1801 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 SRGNP10124 158 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 ADCY7P51828 1080 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 TEX35Q5T0J7 233 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 ACRBPQ8NEB7 543 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 IQCDQ96DY2 449 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
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SPNS1-201ENST00000311008 POTEB2H3BUK9 544 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 GTF2IP78347 998 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 SV2BQ7L1I2 683 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 LRRC15Q8TF66 581 aa21.9■■□□□ 1.1
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SPNS1-201ENST00000311008 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 CHMP4BP1P59074 171 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 PDIA5Q14554 519 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 CALCRLQ16602 461 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-201ENST00000311008 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
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