RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 NUDT12Q9BQG2 462 aa25.87■■□□□ 1.73
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HOXD4-201ENST00000306324 CPLX1O14810 134 aa25.86■■□□□ 1.73
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HOXD4-201ENST00000306324 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
HOXD4-201ENST00000306324 FUT2Q10981 343 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD4-201ENST00000306324 SCRN1Q12765 414 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD4-201ENST00000306324 KCTD2Q14681 263 aa25.86■■□□□ 1.73
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HOXD4-201ENST00000306324 GJD2Q9UKL4 321 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXD4-201ENST00000306324 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXD4-201ENST00000306324 V9GY48 417 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
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HOXD4-201ENST00000306324 PTPN22Q9Y2R2 807 aa25.84■■□□□ 1.73
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HOXD4-201ENST00000306324 MAP2K5Q13163 448 aa25.83■■□□□ 1.73
HOXD4-201ENST00000306324 NSMFQ6X4W1 530 aa25.83■■□□□ 1.73
HOXD4-201ENST00000306324 DPP9Q86TI2 863 aa25.83■■□□□ 1.73
HOXD4-201ENST00000306324 SLC26A6Q9BXS9 759 aa25.83■■□□□ 1.73
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HOXD4-201ENST00000306324 GTF3C6Q969F1 213 aa25.82■■□□□ 1.72
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HOXD4-201ENST00000306324 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa25.82■■□□□ 1.72
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HOXD4-201ENST00000306324 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP25.8■■□□□ 1.72
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HOXD4-201ENST00000306324 RNF207Q6ZRF8 634 aa25.79■■□□□ 1.72
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HOXD4-201ENST00000306324 CYP39A1Q9NYL5 469 aa25.79■■□□□ 1.72
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HOXD4-201ENST00000306324 MCM2P49736 904 aa25.78■■□□□ 1.72
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HOXD4-201ENST00000306324 WWC2Q6AWC2 1192 aa25.78■■□□□ 1.72
HOXD4-201ENST00000306324 MCF2L2Q86YR7 1114 aa25.78■■□□□ 1.72
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC83Q8IWF9 413 aa25.78■■□□□ 1.72
HOXD4-201ENST00000306324 NPLOC4Q8TAT6 608 aa25.78■■□□□ 1.72
HOXD4-201ENST00000306324 MCOLN1Q9GZU1 580 aa25.78■■□□□ 1.72
HOXD4-201ENST00000306324 POTEB2H3BUK9 544 aa25.77■■□□□ 1.72
HOXD4-201ENST00000306324 ADCY3O60266 1144 aa25.77■■□□□ 1.72
HOXD4-201ENST00000306324 CFBP00751 764 aa25.77■■□□□ 1.72
HOXD4-201ENST00000306324 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
HOXD4-201ENST00000306324 SCG2P13521 617 aa25.77■■□□□ 1.72
HOXD4-201ENST00000306324 CALML3P27482 149 aa25.77■■□□□ 1.72
HOXD4-201ENST00000306324 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
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HOXD4-201ENST00000306324 OPLAHO14841 1288 aa25.76■■□□□ 1.71
HOXD4-201ENST00000306324 HOXC6P09630 235 aa25.76■■□□□ 1.71
HOXD4-201ENST00000306324 ELNP15502 786 aa25.76■■□□□ 1.71
HOXD4-201ENST00000306324 RPS6P62753 249 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
HOXD4-201ENST00000306324 ST3GAL1Q11201 340 aa25.76■■□□□ 1.71
HOXD4-201ENST00000306324 CCL14Q16627 93 aa25.76■■□□□ 1.71
HOXD4-201ENST00000306324 SLC30A10Q6XR72 485 aa25.76■■□□□ 1.71
HOXD4-201ENST00000306324 CTDNEP1O95476 244 aa25.75■■□□□ 1.71
HOXD4-201ENST00000306324 NAPAP54920 295 aa25.75■■□□□ 1.71
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