RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296051.6

HPS3-201, Transcript of HPS3, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS3, Length 4,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3-201ENST00000296051 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.82□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 SERPINA10Q9UK55 444 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 HEG1Q9ULI3 1381 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 IQGAP3Q86VI3 1631 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 GDF11O95390 407 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 DAAM2Q86T65 1068 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 FBF1Q8TES7 1133 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
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HPS3-201ENST00000296051 E2F5Q15329 346 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 SLFN13Q68D06 897 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 METTL13Q8N6R0 699 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 SAMD15Q9P1V8 674 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 ABCC3O15438 1527 aa14.82□□□□□ -0.04
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HPS3-201ENST00000296051 HECW2Q9P2P5 1572 aa14.81□□□□□ -0.04
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HPS3-201ENST00000296051 SHC4Q6S5L8 630 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 ERVV-1B6SEH8 477 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 KLHL30Q0D2K2 578 aa14.81□□□□□ -0.04
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HPS3-201ENST00000296051 DPH5Q9H2P9 285 aa14.81□□□□□ -0.04
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HPS3-201ENST00000296051 RASSF7Q02833 373 aa14.8□□□□□ -0.04
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HPS3-201ENST00000296051 HAUS3Q68CZ6 603 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 CCDC65Q8IXS2 484 aa14.8□□□□□ -0.04
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HPS3-201ENST00000296051 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 NUP58Q9BVL2 599 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
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HPS3-201ENST00000296051 ARHGAP25P42331 645 aa14.8□□□□□ -0.04
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HPS3-201ENST00000296051 USP17L3A6NCW0 530 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 USP17L4A6NCW7 530 aa14.8□□□□□ -0.04
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HPS3-201ENST00000296051 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 USP17L1Q7RTZ2 530 aa14.8□□□□□ -0.04
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HPS3-201ENST00000296051 KLRF2D3W0D1 207 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 SEMA3EO15041 775 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 USP17L8P0C7I0 530 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
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HPS3-201ENST00000296051 SMCO2A6NFE2 343 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 TECP42680 631 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 PDCLQ13371 301 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 KRT31Q15323 416 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 RPS6KA1Q15418 735 aa14.79□□□□□ -0.04
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HPS3-201ENST00000296051 FERMT1Q9BQL6 677 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP14.79□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 PLA2G4AP47712 749 aa14.79□□□□□ -0.04
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HPS3-201ENST00000296051 CLEC4GQ6UXB4 293 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 SYNE4Q8N205 404 aa14.79□□□□□ -0.04
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HPS3-201ENST00000296051 EPB41L5Q9HCM4 733 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 ADGRG1Q9Y653 693 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 MFAP3LO75121 409 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 CDC27P30260 824 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 STRN3Q13033 797 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 KRT12Q99456 494 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS3-201ENST00000296051 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
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