RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 ROBO2Q9HCK4 1378 aa9.92□□□□□ -0.82
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PTPRB-201ENST00000261266 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.82
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PTPRB-201ENST00000261266 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
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PTPRB-201ENST00000261266 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
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PTPRB-201ENST00000261266 SMC1BQ8NDV3 1235 aa9.9□□□□□ -0.82
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PTPRB-201ENST00000261266 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRB-201ENST00000261266 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
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