RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243082.4

HOXC11-201, Transcript of homeobox C11, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC11, Length 2,039 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11-201ENST00000243082 CBFA2T2O43439 604 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXC11-201ENST00000243082 UBE2SQ16763 222 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXC11-201ENST00000243082 QRICH1Q2TAL8 776 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXC11-201ENST00000243082 POTEDQ86YR6 584 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXC11-201ENST00000243082 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
HOXC11-201ENST00000243082 OGFOD1Q8N543 542 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXC11-201ENST00000243082 FAM151AQ8WW52 585 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXC11-201ENST00000243082 MTMR9Q96QG7 549 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXC11-201ENST00000243082 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
HOXC11-201ENST00000243082 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
HOXC11-201ENST00000243082 LRRC15Q8TF66 581 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 CUL5Q93034 780 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 GMCL1Q96IK5 515 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP20.89■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 PIM2Q9P1W9 311 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 TGFB2P61812 414 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 CCZ1BP86790 482 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 SPDYE2Q495Y8 402 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 NIM1KQ8IY84 436 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 FBXO41Q8TF61 875 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 CNTNAP1P78357 1384 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 ZBTB7AO95365 584 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 NDUFB10O96000 172 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 TECP42680 631 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 CABP7Q86V35 215 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 IGSF22Q8N9C0 903 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 AGBL3Q8NEM8 1001 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 PSTPIP2Q9H939 334 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 INTS13Q9NVM9 706 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 A0A1W2PRG0 241 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 SLC37A4O43826 429 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 TDP2O95551 362 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 RPN1P04843 607 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 TNNI2P48788 182 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 KLHL10Q6JEL2 608 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 ARMCX5Q6P1M9 558 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 PLIN2Q99541 437 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 KBTBD4Q9NVX7 518 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 SKILP12757 684 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 CALCRLQ16602 461 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 SPATA1Q5VX52 437 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 MTMR14Q8NCE2 650 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 TMEM232C9JQI7 657 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 PLCG1P19174 1290 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 STX17P56962 302 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 CXCL9Q07325 125 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 VSTM4Q8IW00 320 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 TXKP42681 527 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 TERF1P54274 439 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 FKBP1CQ5VVH2 108 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 PPP4R3AQ6IN85 833 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 RMND1Q9NWS8 449 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 MYL1P05976 194 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.85■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 CCDC150Q8NCX0 1101 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 CUEDC2Q9H467 287 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 KLRC4O43908 158 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 BMP3P12645 472 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 GLT8D2Q9H1C3 349 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 VEZTQ9HBM0 779 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 USP17L15C9J2P7 530 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 USP17L11C9JVI0 530 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 USP17L18D6R9N7 530 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 USP17L22D6RA61 530 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 USP17L17D6RBQ6 530 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 USP17L19D6RCP7 530 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 USP17L20D6RJB6 530 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 USP17L24Q0WX57 530 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 CDKAL1Q5VV42 579 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 BTNL9Q6UXG8 535 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 CDAN1Q8IWY9 1227 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 MAGEF1Q9HAY2 307 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC11-201ENST00000243082 ECE1P42892 770 aa20.83■□□□□ 0.92
HOXC11-201ENST00000243082 SNAP25P60880 206 aa20.83■□□□□ 0.92
HOXC11-201ENST00000243082 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
HOXC11-201ENST00000243082 KCNB1Q14721 858 aa20.83■□□□□ 0.92
HOXC11-201ENST00000243082 SYDE2Q5VT97 1194 aa20.83■□□□□ 0.92
HOXC11-201ENST00000243082 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
HOXC11-201ENST00000243082 TMEM39BQ9GZU3 492 aa20.83■□□□□ 0.92
HOXC11-201ENST00000243082 CTNND2Q9UQB3 1225 aa20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms