RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243056.4

HOXC13-201, Transcript of homeobox C13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC13, Length 2,423 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13-201ENST00000243056 GUCY1B3Q02153 619 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 E2F5Q15329 346 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 SNCBQ16143 134 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 PPIP5K2O43314 1243 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 PEX19P40855 299 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 RWDD2BP57060 319 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 CCDC148Q8NFR7 591 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 PIM2Q9P1W9 311 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 BCS1LQ9Y276 419 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 PDCLQ13371 301 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 ATL3Q6DD88 541 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 ZBTB10Q96DT7 871 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 ZMYND10O75800 440 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 SELENOOQ9BVL4 669 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 YDJCA8MPS7 323 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 RPSAP08865 295 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 FAM210AQ96ND0 272 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 EYA3Q99504 573 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 SNED1Q8TER0 1413 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 GOLGA6BA6NDN3 693 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 PPFIA3O75145 1194 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 EZRP15311 586 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 AMPD2Q01433 879 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 SNX1Q13596 522 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 PLCB4Q15147 1175 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 PARP9Q8IXQ6 854 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 CTDNEP1O95476 244 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 CYP2D6P10635 497 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 Q6ZUG5 572 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 CLIC4Q9Y696 253 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 SPDL1Q96EA4 605 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 SCN9AQ15858 1988 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 RAD17O75943 681 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 RPS6KA3P51812 740 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 LINC00301Q8NCQ3 95 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 SCLT1Q96NL6 688 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 TUBE1Q9UJT0 475 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 B4E1Z4 1266 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 PRDM1O75626 825 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 SLC8A3P57103 927 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 CYB5D1Q6P9G0 228 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 MAB21L3Q8N8X9 362 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC13-201ENST00000243056 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 BTDP43251 543 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 CDR1P51861 262 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 TGFB2P61812 414 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 MYO6Q9UM54 1294 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 COL4A5P29400 1685 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 USP17L12C9JPN9 530 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 USP17L21D6R901 530 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 PFKFB1P16118 471 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 SKOR1P84550 965 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 NAA35Q5VZE5 725 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 USP17L8P0C7I0 530 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 PDE4BQ07343 736 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 TRAF1Q13077 416 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 KCNB1Q14721 858 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 MAGEC3Q8TD91 643 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 ENO4A6NNW6 628 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 KRT32Q14532 448 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC13-201ENST00000243056 STK38Q15208 465 aa22.12■■□□□ 1.13
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