RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 DDX11Q96FC9 970 aa25.94■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 TM6SF1Q9BZW5 370 aa25.94■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 SLC5A4Q9NY91 659 aa25.94■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 MYH6P13533 1939 aa25.93■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 GJB1P08034 283 aa25.93■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 EN2P19622 333 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 CNTN2Q02246 1040 aa25.93■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 FAM133AQ8N9E0 248 aa25.93■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 FANCBQ8NB91 859 aa25.93■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 TRPV1Q8NER1 839 aa25.93■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 IL17RAQ96F46 866 aa25.93■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 TMEM106CQ9BVX2 250 aa25.93■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 CYP39A1Q9NYL5 469 aa25.93■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 LCTP09848 1927 aa25.93■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 PLEKHA8P1O95397 391 aa25.92■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 RUFY3Q7L099 469 aa25.92■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa25.92■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 PIGSQ96S52 555 aa25.92■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 PNMA2Q9UL42 364 aa25.92■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 ASTN1O14525 1302 aa25.92■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB5O15062 677 aa25.91■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 CALM1P0DP23 149 aa25.91■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 CALM2P0DP24 149 aa25.91■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 CALM3P0DP25 149 aa25.91■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 SMARCA1P28370 1054 aa25.91■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 USH1GQ495M9 461 aa25.91■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 MFSD14CQ5VZR4 134 aa25.91■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 SHISA4Q96DD7 197 aa25.91■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP25.91■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 SOWAHBA6NEL2 793 aa25.9■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 KIF5BP33176 963 aa25.9■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 GJA8P48165 433 aa25.9■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa25.9■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 MICU3Q86XE3 530 aa25.9■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 FBXO11Q86XK2 927 aa25.9■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D5Q92609 795 aa25.9■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 BRF1Q92994 677 aa25.9■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 TINF2Q9BSI4 451 aa25.9■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 SPZ1Q9BXG8 430 aa25.9■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa25.89■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 CYBAP13498 195 aa25.89■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 APOBRQ0VD83 1088 aa25.89■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa25.89■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 NSMFQ6X4W1 530 aa25.89■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 PFASO15067 1338 aa25.89■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 POTEB2H3BUK9 544 aa25.88■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 OPLAHO14841 1288 aa25.88■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 SGPL1O95470 568 aa25.88■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 EVCP57679 992 aa25.88■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 ANAPC15P60006 121 aa25.88■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 TMTC3Q6ZXV5 915 aa25.88■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 RGS22Q8NE09 1264 aa25.88■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 DEFB118Q96PH6 123 aa25.88■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 LZTS2Q9BRK4 669 aa25.88■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa25.88■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 ABCB11O95342 1321 aa25.88■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa25.88■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB43O43298 467 aa25.88■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 GNAQP50148 359 aa25.88■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 FUT2Q10981 343 aa25.88■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 LHX8Q68G74 356 aa25.88■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 HOMER1Q86YM7 354 aa25.88■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 AMNQ9BXJ7 453 aa25.88■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa25.88■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 MCM3APO60318 1980 aa25.87■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 CDC27P30260 824 aa25.87■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 RCAN1P53805 252 aa25.87■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 SLC30A10Q6XR72 485 aa25.87■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa25.87■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 RPS6P62753 249 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa25.86■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa25.85■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 FGD1P98174 961 aa25.85■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 RNF207Q6ZRF8 634 aa25.85■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 CCDC82Q8N4S0 544 aa25.85■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 PIBF1Q8WXW3 757 aa25.85■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 KATNBL1Q9H079 304 aa25.85■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 PTPDC1A2A3K4 754 aa25.84■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 ADD1P35611 737 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
SYF2-201ENST00000236273 GHRHRQ02643 423 aa25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms