RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216121.11

NIPSNAP1-201, Transcript of nipsnap homolog 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NIPSNAP1, Length 2,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GOLGA1Q92805 767 aa24.77■■□□□ 1.56
NIPSNAP1-201ENST00000216121 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.77■■□□□ 1.56
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ESYT2A0FGR8 921 aa24.76■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ATP8B1O43520 1251 aa24.76■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 C7orf25Q9BPX7 421 aa24.76■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CDC23Q9UJX2 597 aa24.76■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TRIM47Q96LD4 638 aa24.76■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PIGSQ96S52 555 aa24.76■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TRIM9Q9C026 710 aa24.76■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 EPC1Q9H2F5 836 aa24.76■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SERPINB2P05120 415 aa24.75■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GYS1P13807 737 aa24.75■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TBC1D16Q8TBP0 767 aa24.75■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RIOX1Q9H6W3 641 aa24.75■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MYO1AQ9UBC5 1043 aa24.75■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 POLLQ9UGP5 575 aa24.75■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FOCADQ5VW36 1801 aa24.74■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ARHGAP25P42331 645 aa24.74■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa24.74■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 OR8K1Q8NGG5 319 aa24.74■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TTC26A0AVF1 554 aa24.74■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TERF2Q15554 542 aa24.74■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TBCKQ8TEA7 893 aa24.74■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 VAT1LQ9HCJ6 419 aa24.74■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CTAGE9A4FU28 777 aa24.73■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 USP17L5A8MUK1 530 aa24.73■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 hCG_1984214I3L0E3 225 aa24.73■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 KIF20AO95235 890 aa24.73■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CEP112Q8N8E3 955 aa24.73■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DNAJC7Q99615 494 aa24.73■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PARD6BQ9BYG5 372 aa24.73■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CAPN11Q9UMQ6 739 aa24.73■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 UBR3Q6ZT12 1888 aa24.73■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PLIN4Q96Q06 1357 aa24.73■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CCNE1P24864 410 aa24.73■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PPP1R2P41236 205 aa24.73■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PLA2G4AP47712 749 aa24.73■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DNM2P50570 870 aa24.73■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SLC35F6Q8N357 371 aa24.73■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CHP1Q99653 195 aa24.73■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PDHBP11177 359 aa24.72■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TECP42680 631 aa24.72■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CHMP4BP1P59074 171 aa24.72■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 AMPD3Q01432 767 aa24.72■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 P2RX5Q93086 422 aa24.72■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 UBA5Q9GZZ9 404 aa24.72■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 EXOC1Q9NV70 894 aa24.72■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 BICDL2A1A5D9 508 aa24.71■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ABL1P00519 1130 aa24.71■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PDE4DQ08499 809 aa24.71■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa24.71■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa24.71■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa24.71■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SLF1Q9BQI6 1058 aa24.71■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NDUFA10O95299 355 aa24.71■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SRGNP10124 158 aa24.71■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 COBLL1Q53SF7 1204 aa24.71■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MTMR4Q9NYA4 1195 aa24.71■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa24.71■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ASIC1P78348 528 aa24.7■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 STK4Q13043 487 aa24.7■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MTMR9Q96QG7 549 aa24.7■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CRAMP1Q96RY5 1269 aa24.7■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa24.7■■□□□ 1.55
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TUBB4BP68371 445 aa24.7■■□□□ 1.54
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GABPAQ06546 454 aa24.7■■□□□ 1.54
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ST7Q9NRC1 585 aa24.7■■□□□ 1.54
NIPSNAP1-201ENST00000216121 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ASPRV1Q53RT3 343 aa24.69■■□□□ 1.54
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ANKRD40Q6AI12 368 aa24.69■■□□□ 1.54
NIPSNAP1-201ENST00000216121 POTEDQ86YR6 584 aa24.69■■□□□ 1.54
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CALML4Q96GE6 196 aa24.69■■□□□ 1.54
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PES1O00541 588 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TBC1D8O95759 1140 aa24.69■■□□□ 1.54
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FAM193AP78312 1265 aa24.69■■□□□ 1.54
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FAM114A1Q8IWE2 563 aa24.69■■□□□ 1.54
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ARFGAP3Q9NP61 516 aa24.69■■□□□ 1.54
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TMEM260Q9NX78 707 aa24.69■■□□□ 1.54
NIPSNAP1-201ENST00000216121 B4DLN1 442 aa24.68■■□□□ 1.54
NIPSNAP1-201ENST00000216121 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.68■■□□□ 1.54
NIPSNAP1-201ENST00000216121 C6orf229H3BNL8 230 aa24.68■■□□□ 1.54
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SNHG28P0DPA3 235 aa24.68■■□□□ 1.54
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
NIPSNAP1-201ENST00000216121 WDR59Q6PJI9 974 aa24.68■■□□□ 1.54
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RETREG2Q8NC44 543 aa24.68■■□□□ 1.54
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NUP58Q9BVL2 599 aa24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms