RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049697.4

Cldn8-201, Transcript of Claudin-8, mousemouse

APPRIS P1 BASIC

Gene Cldn8, Length 2,356 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Tight Junction .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Fbxl16A2RT62 479 aa11.15□□□□□ -0.62
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Lig1P37913 916 aa11.15□□□□□ -0.62
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Kifap3P70188 793 aa11.15□□□□□ -0.62
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Pla2g6P97819 807 aa11.15□□□□□ -0.62
Cldn8-201ENSMUST00000049697 MycbpapQ5SUV2 932 aa11.15□□□□□ -0.62
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Rgl1Q60695 768 aa11.15□□□□□ -0.62
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Fsd1Q7TPM6 496 aa11.15□□□□□ -0.62
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Tbc1d10bQ8BHL3 798 aa11.15□□□□□ -0.62
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Bola3Q8CEI1 110 aa11.15□□□□□ -0.62
Cldn8-201ENSMUST00000049697 PdgfcQ8CI19 345 aa11.15□□□□□ -0.62
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Alg3Q8K2A8 438 aa11.15□□□□□ -0.62
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Pof1bQ8K4L4 587 aa11.15□□□□□ -0.62
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Sgpl1Q8R0X7 568 aa11.15□□□□□ -0.62
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Slc12a8Q8VI23 705 aa11.15□□□□□ -0.62
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Ubiad1Q9DC60 336 aa11.15□□□□□ -0.62
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Pidd1Q9ERV7 915 aa11.15□□□□□ -0.62
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Astn1Q61137 1302 aa11.15□□□□□ -0.62
Cldn8-201ENSMUST00000049697 SpibO35906 267 aa11.14□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Calm1P0DP26 149 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Calm2P0DP27 149 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Calm3P0DP28 149 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Cyp2e1Q05421 493 aa11.14□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Neurl1bQ0MW30 546 aa11.14□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Rasip1Q3U0S6 961 aa11.14□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Crhr2Q60748 411 aa11.14□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Hoxa13Q62424 386 aa11.14□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 KinQ8K339 391 aa11.14□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Slc5a5Q99PN0 618 aa11.14□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Rufy3Q9D394 469 aa11.14□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Ccdc7Q9D541 371 aa11.14□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Jakmip3Q5DTN8 844 aa11.14□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Churc1Q6DG52 112 aa11.14□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Glipr1l2Q9CQ35 332 aa11.14□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Ccdc47Q9D024 483 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 NkapQ9D0F4 415 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Rnf19bA2A7Q9 732 aa11.13□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Rasa1E9PYG6 1038 aa11.13□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Magea4F2Z493 315 aa11.13□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Smarce1O54941 411 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Nck2O55033 380 aa11.13□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Rps6P62754 249 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Cln3Q61124 438 aa11.13□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Ddx4Q61496 702 aa11.13□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Tpcn2Q8BWC0 731 aa11.13□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Rtn1Q8K0T0 780 aa11.13□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Kiaa1024Q8K3V7 917 aa11.13□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Mrpl58Q8R035 206 aa11.13□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Gm3138K7N754 218 aa11.13□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Gdf10P97737 476 aa11.13□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Atp9bP98195 1146 aa11.13□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Wdr70Q3TWF6 657 aa11.13□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Cyp2c29Q64458 490 aa11.13□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Nxf7Q80SZ6 620 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Ranbp6Q8BIV3 1105 aa11.13□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Snx17Q8BVL3 470 aa11.13□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Mknk2Q8CDB0 459 aa11.13□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Tmem191cQ9JJB1 302 aa11.13□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Gm45140A0A0N4SUM8 220 aa11.12□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 C87977A2A958 498 aa11.12□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Nfx1B1AY10 1114 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Hoxc6P10629 235 aa11.12□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 EporP14753 507 aa11.12□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Adamts10P58459 1104 aa11.12□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Gprc5cQ8K3J9 440 aa11.12□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Rbm10Q99KG3 930 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Mrpl11Q9CQF0 192 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Cep89Q9CZX2 791 aa11.12□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Gm44511A0A0N4SW10 223 aa11.12□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Pabpc1lA2A5N3 607 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 MthfslL7N466 203 aa11.12□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 GnaqP21279 359 aa11.12□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Klrb1bP27812 223 aa11.12□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Fads2p1Q0VAX3 487 aa11.12□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Prmt6Q6NZB1 378 aa11.12□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Zdhhc15Q8BGJ0 337 aa11.12□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Lrrc56Q8K375 552 aa11.12□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Fubp1Q91WJ8 651 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Pcdhgc5Q91XW9 944 aa11.12□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Xrn2Q9DBR1 951 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Twf2Q9Z0P5 349 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Btnl4A2CG29 586 aa11.11□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 NcapgE9PWG6 1004 aa11.11□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Elmsan1E9Q2I4 1089 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Phldb3E9QAF4 648 aa11.11□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Btg4O70552 250 aa11.11□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Slc6a20bO88575 635 aa11.11□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 PhkbQ7TSH2 1085 aa11.11□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Pramel7Q810Y8 479 aa11.11□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 BrapQ99MP8 591 aa11.11□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Znf687Q9D2D7 1237 aa11.11□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Erich6bQ9D4S6 220 aa11.11□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Gdpd2Q9ESM6 539 aa11.11□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Dnajb2Q9QYI5 324 aa11.11□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Ifi202Q9R002 445 aa11.11□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Sel1lQ9Z2G6 790 aa11.11□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Trdmt1O55055 415 aa11.11□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 FosbP13346 338 aa11.11□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Irs1P35569 1233 aa11.11□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Tnnt2P50752 301 aa11.11□□□□□ -0.63
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Ece1Q4PZA2 769 aa11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.6 ms