RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049074.12

Ptprf-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ptprf, Length 7,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rbm41Q8JZV4 413 aa19.11■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccdc97Q9DBT3 340 aa19.11■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa19.1■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rasgrf1P27671 1262 aa19.1■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm5592Q3V0A6 857 aa19.1■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lamc2Q61092 1191 aa19.1■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Atad3Q925I1 591 aa19.1■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kdelc2G5E897 503 aa19.1■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 SarnpQ9D1J3 210 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gbp2Q9Z0E6 589 aa19.1■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tns3Q5SSZ5 1440 aa19.1■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Anks6Q6GQX6 883 aa19.1■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ces1Q8VCC2 565 aa19.1■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pold3Q9EQ28 462 aa19.1■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cpsf2O35218 782 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Clic6Q8BHB9 596 aa19.1■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Naa25Q8BWZ3 972 aa19.1■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Atg3Q9CPX6 314 aa19.1■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ola1Q9CZ30 396 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pik3r1P26450 724 aa19.1■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ubxn2bQ0KL01 331 aa19.1■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ncoa4Q5U4H9 625 aa19.1■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Serpinb12Q9D7P9 423 aa19.1■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Senp1P59110 640 aa19.1■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sos2Q02384 1333 aa19.09■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pfdn6Q03958 127 aa19.09■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 EmsyQ8BMB0 1264 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mei1Q9D4I2 1268 aa19.09■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rps6ka1P18653 724 aa19.09■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Brd2Q7JJ13 798 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccdc28aQ8CEI3 192 aa19.09■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Atp10aO54827 1508 aa19.09■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Med23Q80YQ2 1367 aa19.09■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Bpifb4A2BGH0 617 aa19.09■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Svs3bQ8BZH8 265 aa19.09■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pde6cQ91ZQ1 861 aa19.09■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccdc70Q9D9B0 223 aa19.09■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mroh6V9GX81 722 aa19.09■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rad51ap2G3UW63 976 aa19.09■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mark2Q05512 776 aa19.09■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Atp2a3Q64518 1038 aa19.09■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Atp6v0d2Q80SY3 350 aa19.09■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rassf9Q8K342 435 aa19.09■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Osbpl5Q9ER64 874 aa19.09■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Asap2Q7SIG6 958 aa19.08■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Iqcb1Q8BP00 598 aa19.08■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gga1Q8R0H9 635 aa19.08■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nol6Q8R5K4 1152 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Spc24Q9D083 201 aa19.08■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Suclg2Q9Z2I8 433 aa19.08■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rrp9Q91WM3 475 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa19.08■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 DonsonQ9QXP4 560 aa19.08■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Myom2Q14BI5 1463 aa19.08■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Calb1P12658 261 aa19.08■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rbm46P86049 533 aa19.08■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccdc125Q5U465 500 aa19.08■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Myef2Q8C854 591 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lmbrd1Q8K0B2 537 aa19.08■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lrrc41Q8K1C9 807 aa19.08■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tbc1d19Q8VDV7 526 aa19.08■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Diaph3Q9Z207 1171 aa19.08■□□□□ 0.65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sycp3P70281 254 aa19.08■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ckap2Q3V1H1 664 aa19.08■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Maip1Q8BHE8 291 aa19.08■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rbbp5Q8BX09 538 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ehd2Q8BH64 543 aa19.08■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 NapgQ9CWZ7 312 aa19.08■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Polr3eQ9CZT4 710 aa19.08■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Bfsp1A2AMT1 669 aa19.07■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 AdkP55264 361 aa19.07■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rpf1Q7TND5 349 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ttll4Q80UG8 1193 aa19.07■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Apol7cQ8C6E1 369 aa19.07■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rsrc1Q9DBU6 334 aa19.07■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gucy1a3Q9ERL9 691 aa19.07■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 IdeQ9JHR7 1019 aa19.07■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fmn2Q9JL04 1578 aa19.07■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dynlt1P51807 113 aa19.07■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mug2P28666 1451 aa19.07■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Krt24A1L317 512 aa19.07■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Serpina3iD3Z450 408 aa19.07■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 NfkbibQ60778 359 aa19.07■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Swap70Q6A028 585 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Elp3Q9CZX0 547 aa19.07■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Adcy8P97490 1249 aa19.07■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm10093D3YYI8 482 aa19.07■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hdac1O09106 482 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 FosP01101 380 aa19.07■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Bola2Q8BGS2 86 aa19.07■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fra10ac1Q8BP78 315 aa19.07■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tubgcp2Q921G8 905 aa19.07■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cxcl11Q9JHH5 100 aa19.07■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Psmg1Q9JK23 289 aa19.07■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cnbd1B1AWM0 430 aa19.06■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rbp3P49194 1234 aa19.06■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nbr1P97432 988 aa19.06■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Golga1Q9CW79 758 aa19.06■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gpaa1Q9WTK3 621 aa19.06■□□□□ 0.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mroh8E9PYI4 1049 aa19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.7 ms