RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028694.11

Pacsin3-201, Transcript of Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pacsin3, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Ube2q1Q7TSS2 422 aa20.93■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Tbc1d5Q80XQ2 815 aa20.93■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Ranbp6Q8BIV3 1105 aa20.93■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Plcd3Q8K2J0 785 aa20.93■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Cep89Q9CZX2 791 aa20.93■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Xrn2Q9DBR1 951 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 JcadQ5DTX6 1320 aa20.93■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Pabpc1lA2A5N3 607 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 MthfslL7N466 203 aa20.92■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Muc1Q02496 630 aa20.92■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Ccdc85aQ5SP85 500 aa20.92■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Cdan1Q8CC12 1239 aa20.92■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Galntl5Q9D4M9 431 aa20.92■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Twf2Q9Z0P5 349 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Dennd4aE9Q8V6 1869 aa20.92■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Gm44511A0A0N4SW10 223 aa20.92■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Phldb3E9QAF4 648 aa20.92■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Klrb1bP27812 223 aa20.92■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Utp18Q5SSI6 552 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Cln3Q61124 438 aa20.92■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Nxf7Q80SZ6 620 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Gjc2Q8BQU6 440 aa20.92■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 PdgfcQ8CI19 345 aa20.92■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Gprc5cQ8K3J9 440 aa20.92■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Adgrf4Q9D2L6 698 aa20.92■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Fkbp1bQ9Z2I2 108 aa20.92■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Btg4O70552 250 aa20.91■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Ctdnep1Q3TP92 244 aa20.91■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Brd9Q3UQU0 596 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Rhpn1Q61085 643 aa20.91■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Ppp1r10Q80W00 888 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Zswim3Q8CFL8 695 aa20.91■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 AnlnQ8K298 1121 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Tbx20Q9ES03 445 aa20.91■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Rcan1Q9JHG6 198 aa20.91■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Dnajb2Q9QYI5 324 aa20.91■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Hoxa13Q62424 386 aa20.9■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Cdkn2aipQ8BI72 563 aa20.9■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 RadxQ8C779 850 aa20.9■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Kiaa1024Q8K3V7 917 aa20.9■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Pof1bQ8K4L4 587 aa20.9■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Cntnap2Q9CPW0 1332 aa20.9■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Prom1O54990 867 aa20.9■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Irs1P35569 1233 aa20.9■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Trappc3lQ4KL14 181 aa20.9■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Mcph1Q7TT79 822 aa20.9■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Cyp26b1Q811W2 512 aa20.9■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 U2af1l4Q8BGJ9 220 aa20.9■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Cchcr1Q8K2I2 770 aa20.9■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Dcaf8Q8N7N5 591 aa20.9■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Fubp1Q91WJ8 651 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 DcpsQ9DAR7 338 aa20.9■□□□□ 0.94
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Parp1P11103 1013 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Foxp1P58462 705 aa20.89■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Jakmip3Q5DTN8 844 aa20.89■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 PhkbQ7TSH2 1085 aa20.89■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Yars2Q8BYL4 472 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Lrrc2Q8VDB8 371 aa20.89■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Kdm4bQ91VY5 1086 aa20.89■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Tll2Q9WVM6 1012 aa20.89■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Arhgap4B1AUY3 965 aa20.88■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Nfx1B1AY10 1114 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Gcnt4E9Q649 455 aa20.88■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Lnx1O70263 728 aa20.88■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Slc6a20bO88575 635 aa20.88■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Eif3j2Q66JS6 263 aa20.88■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Tdp1Q8BJ37 609 aa20.88■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Eif4enif1Q9EST3 983 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Plxnb3Q9QY40 1902 aa20.88■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Ttc6G3UYY4 1857 aa20.88■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Pfkfb3A7UAK5 555 aa20.88■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Gm20425E9Q035 978 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Fzd1O70421 642 aa20.88■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Gja8P28236 440 aa20.88■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 SrprbP47758 269 aa20.88■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 PRAG1Q571I4 1179 aa20.88■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Rufy2Q8R4C2 606 aa20.88■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Prpf3Q922U1 683 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Hic1Q9R1Y5 733 aa20.88■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Stk39Q9Z1W9 556 aa20.88■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Dhx8A2A4P0 1244 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Dnai2A2AC93 623 aa20.87■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Gm10093D3YYI8 482 aa20.87■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Zbtb21E9Q444 1094 aa20.87■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Hdac1O09106 482 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Pitpnm1O35954 1243 aa20.87■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 PtpreP49446 699 aa20.87■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Meis2P97367 477 aa20.87■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Casc1Q6TDU8 730 aa20.87■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Zcchc18Q8VD24 393 aa20.87■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Tob2Q9JM55 345 aa20.87■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Ubxn8Q9QZ49 277 aa20.87■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Cdc45Q9Z1X9 566 aa20.87■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Rnf19bA2A7Q9 732 aa20.86■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Stat1P42225 749 aa20.86■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Prmt6Q6NZB1 378 aa20.86■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Havcr2Q8VIM0 281 aa20.86■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Ccdc7Q9D541 371 aa20.86■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Oip5A2AQ14 241 aa20.86■□□□□ 0.93
Pacsin3-201ENSMUST00000028694 Sept4P28661 478 aa20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.6 ms