RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000016569.10

Pds5b-201, Transcript of Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pds5b, Length 7,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Rasgrf1P27671 1262 aa14.61□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 C87499Q3UX49 493 aa14.61□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Rnf207Q3V3A7 635 aa14.61□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ppp2r5cQ60996 524 aa14.61□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Surf1P09925 306 aa14.61□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Kiaa1468Q148V7 1216 aa14.61□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 HomezQ80W88 542 aa14.61□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Serpinb13Q8CDC0 389 aa14.61□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 YarsQ91WQ3 528 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Zfyve19Q9DAZ9 389 aa14.61□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 IdeQ9JHR7 1019 aa14.61□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 GsdmeQ9Z2D3 512 aa14.61□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Suclg2Q9Z2I8 433 aa14.61□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 AnkarA2RT91 1465 aa14.61□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ppfia4B8QI36 1187 aa14.61□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Parp10Q8CIE4 960 aa14.61□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Sdr42e1Q9D665 394 aa14.61□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Nfe2l3Q9WTM4 660 aa14.61□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Mast1Q9R1L5 1570 aa14.61□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Dach1Q9QYB2 751 aa14.61□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Dpp8Q80YA7 892 aa14.6□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Kctd10Q922M3 315 aa14.6□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Smc6Q924W5 1097 aa14.6□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Cxcl11Q9JHH5 100 aa14.6□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa14.6□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Kmt5aQ2YDW7 349 aa14.6□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Erp44Q9D1Q6 406 aa14.6□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ankrd6Q69ZU8 712 aa14.6□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ddx31Q6NZQ2 687 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Snx14Q8BHY8 964 aa14.6□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Tmem87aQ8BXN9 555 aa14.6□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ccdc15Q8C9M2 810 aa14.6□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 SnrkQ8VDU5 748 aa14.6□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Tmod4Q9JLH8 345 aa14.6□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Slc12a7Q9WVL3 1083 aa14.6□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 StrbpQ91WM1 672 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Pcdhb15Q91Y04 786 aa14.6□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ctnnd1P30999 938 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Stat5bP42232 786 aa14.6□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Gpr182P43142 395 aa14.6□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Madcam1Q61826 405 aa14.6□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Brpf3B2KF05 1204 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Sox5P35710 763 aa14.59□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Mrps22Q9CXW2 359 aa14.59□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 HnrnpcQ9Z204 313 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Tom1l2Q5SRX1 507 aa14.59□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Klhl29Q80T74 875 aa14.59□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 AsphQ8BSY0 741 aa14.59□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 GancQ8BVW0 898 aa14.59□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Elmsan1E9Q2I4 1089 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Cd72P21855 354 aa14.59□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Anapc5Q8BTZ4 740 aa14.59□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Tulp1Q9Z273 543 aa14.59□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Adgrl1Q80TR1 1466 aa14.59□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Pus7B7ZNL8 666 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Tnnc2P20801 160 aa14.59□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 YwhagP61982 247 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Atp8a1P70704 1164 aa14.59□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Stx2Q00262 289 aa14.59□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 HdxQ14B70 692 aa14.59□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Cep70Q6IQY5 616 aa14.59□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 GlyctkQ8QZY2 523 aa14.59□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Usp33Q8R5K2 909 aa14.59□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Mylk2Q8VCR8 613 aa14.59□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Arhgef10lA2AWP8 1280 aa14.59□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 A0A1Y7VML8 143 aa14.59□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 4932429P05RikA2ADI4 785 aa14.59□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Krt78E9Q0F0 1068 aa14.59□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Copb2O55029 905 aa14.59□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Atp8b1Q148W0 1251 aa14.59□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Iqsec3Q3TES0 1195 aa14.59□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ccdc68Q8BVC4 333 aa14.59□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Rabep2Q91WG2 554 aa14.59□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Taf7lQ9D3R9 471 aa14.59□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Mroh8E9PYI4 1049 aa14.58□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Trmt44Q9D2Q2 713 aa14.58□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Mei1Q9D4I2 1268 aa14.58□□□□□ -0.07
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Rabgap1A2AWA9 1064 aa14.58□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Fen1P39749 378 aa14.58□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Irx1P81068 480 aa14.58□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Myo1gQ5SUA5 1024 aa14.58□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Sorbs1Q62417 1290 aa14.58□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Rbbp5Q8BX09 538 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Mrpl50Q8VDT9 159 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 4930449I24RikQ9D5E3 319 aa14.58□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Tfap4Q9JIZ5 338 aa14.58□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Peg3Q3URU2 1571 aa14.58□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Il7P10168 154 aa14.58□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Trmt112Q9DCG9 125 aa14.58□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Plekhg1F6S200 1446 aa14.58□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Adcy9P51830 1353 aa14.58□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Pagr1bF6V0H0 108 aa14.58□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 TxkP42682 527 aa14.58□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Znf532Q6NXK2 1036 aa14.58□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Zfp317Q8C0Q5 607 aa14.58□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Plcg2Q8CIH5 1265 aa14.58□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Emilin1Q99K41 1017 aa14.58□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Pagr1aQ99L02 253 aa14.58□□□□□ -0.08
Pds5b-201ENSMUST00000016569 1700109H08RikQ9D9C0 210 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.9 ms